232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1803 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 324 aa  604  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  37.01 
 
 		 281 aa  126  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  28.08 
 
 		 305 aa  106  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  30 
 
 		 285 aa  98.6  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  31.18 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  34.19 
 
 		 296 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  32.74 
 
 		 292 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  30.8 
 
 		 283 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.68 
 
 		 306 aa  86.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.34 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  31.58 
 
 		 312 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  29.3 
 
 		 299 aa  83.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  27.03 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.56 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  30.1 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  32.03 
 
 		 302 aa  80.9  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  31.19 
 
 		 292 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  27.78 
 
 		 295 aa  81.6  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  32.44 
 
 		 291 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.99 
 
 		 293 aa  78.2  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  31.16 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  31.65 
 
 		 299 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.96 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.57 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  29.89 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.07 
 
 		 287 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 296 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.08 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  27.47 
 
 		 305 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  28.03 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  29.35 
 
 		 312 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.34 
 
 		 298 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  29.62 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  30.51 
 
 		 297 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  29.64 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.73 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  30.6 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  25.45 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  24.9 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  28.93 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  26.04 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.56 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  28.41 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.46 
 
 		 289 aa  58.9  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  27.93 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.2 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  29.92 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  29.92 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  29.92 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.46 
 
 		 319 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  29.2 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.52 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  26.77 
 
 		 395 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  27.68 
 
 		 308 aa  56.6  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.88 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  30.71 
 
 		 309 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  26.77 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  25 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.97 
 
 		 312 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  27.43 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.78 
 
 		 296 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  27.9 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  26.77 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  26.77 
 
 		 316 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  26.77 
 
 		 296 aa  54.7  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  27.01 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.92 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  30.08 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  25.82 
 
 		 414 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  26.77 
 
 		 296 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 325 aa  53.9  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.24 
 
 		 316 aa  53.5  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  29.52 
 
 		 287 aa  53.1  0.000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  30.45 
 
 		 309 aa  52.8  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  27.04 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  26.71 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  26.71 
 
 		 298 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  25.5 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  28.24 
 
 		 310 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.42 
 
 		 314 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  29.53 
 
 		 317 aa  51.6  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  30.04 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0732  hypothetical protein  26.84 
 
 		 343 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  31.48 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.79 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0363  hypothetical protein  27.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.1109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  34.62 
 
 		 291 aa  50.4  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  28.07 
 
 		 309 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0663  putative transporter  27.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.391495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2499  putative transporter  27.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 324 aa  50.4  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0112  putative transporter  27.84 
 
 		 294 aa  50.4  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0697635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>