More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3854 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
293 aa  564  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  67.59 
 
 
296 aa  378  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  68.88 
 
 
283 aa  358  5e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  59.93 
 
 
289 aa  331  8e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  55.52 
 
 
308 aa  269  4e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  55.7 
 
 
292 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  55.74 
 
 
292 aa  258  9e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  52.63 
 
 
307 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  55.36 
 
 
289 aa  241  1e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 
305 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 
305 aa  236  3e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  46.43 
 
 
285 aa  228  9e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  48.97 
 
 
291 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  42.41 
 
 
305 aa  225  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.24 
 
 
291 aa  224  1e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  46.26 
 
 
295 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  49.82 
 
 
298 aa  222  4.9999999999999996e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.99 
 
 
295 aa  221  9e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  47.08 
 
 
291 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  49.48 
 
 
296 aa  218  7e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.59 
 
 
294 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  43.64 
 
 
305 aa  204  2e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  42.51 
 
 
299 aa  203  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  41.67 
 
 
295 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  45.77 
 
 
291 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  47.62 
 
 
298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  46.27 
 
 
296 aa  195  9e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  44.48 
 
 
300 aa  194  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  48.41 
 
 
293 aa  192  7e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.9 
 
 
296 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.02 
 
 
307 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  46.02 
 
 
307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  41.28 
 
 
306 aa  181  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  40.99 
 
 
281 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  37.23 
 
 
307 aa  178  1e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  41.26 
 
 
286 aa  175  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  42.61 
 
 
297 aa  175  7e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  40.49 
 
 
297 aa  175  8e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  46.02 
 
 
306 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
299 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.85 
 
 
296 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  40.41 
 
 
289 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  40.14 
 
 
325 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.46 
 
 
299 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.24 
 
 
299 aa  165  8e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  40.07 
 
 
289 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  43.75 
 
 
317 aa  162  7e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  40.27 
 
 
291 aa  159  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  39.04 
 
 
289 aa  159  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  38.7 
 
 
289 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.11 
 
 
290 aa  150  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  37.07 
 
 
309 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  40.15 
 
 
302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  39.07 
 
 
304 aa  140  3e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  41.43 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  42.14 
 
 
301 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.65 
 
 
313 aa  137  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  33.56 
 
 
319 aa  136  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  41.16 
 
 
301 aa  133  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  39.17 
 
 
323 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  37.32 
 
 
293 aa  122  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  34.52 
 
 
299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  32.17 
 
 
305 aa  120  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  32.62 
 
 
289 aa  119  7.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  34.52 
 
 
315 aa  115  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  34.98 
 
 
310 aa  115  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  33.81 
 
 
307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  35.05 
 
 
302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.62 
 
 
297 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.04 
 
 
287 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  33.22 
 
 
298 aa  104  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  34.28 
 
 
307 aa  103  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  33.45 
 
 
287 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  31.54 
 
 
312 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  35.59 
 
 
293 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  35.25 
 
 
293 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  35.59 
 
 
293 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
313 aa  98.6  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  34.88 
 
 
293 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  34.16 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.33 
 
 
287 aa  96.7  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  36.49 
 
 
287 aa  95.9  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.61 
 
 
304 aa  95.5  9e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  34.18 
 
 
310 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  29.58 
 
 
308 aa  95.5  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  94.7  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  38.73 
 
 
287 aa  94.4  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  38.73 
 
 
287 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.85 
 
 
293 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  38.03 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  38.38 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>