297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2187 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 296 aa  550  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  90.54 
 
 		 307 aa  451  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  90.54 
 
 		 307 aa  450  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  62.26 
 
 		 296 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  65.22 
 
 		 302 aa  277  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  62.26 
 
 		 296 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  48.11 
 
 		 296 aa  221  9.999999999999999e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  44.06 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  43.01 
 
 		 285 aa  212  7e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  46.15 
 
 		 296 aa  208  9e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.72 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  47.5 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.55 
 
 		 290 aa  189  5e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.17 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.4 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.75 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  44.84 
 
 		 289 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  43.49 
 
 		 308 aa  180  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  40.83 
 
 		 289 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  41.03 
 
 		 289 aa  179  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  40.07 
 
 		 307 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.48 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  41.96 
 
 		 286 aa  176  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  39.1 
 
 		 325 aa  175  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  39.72 
 
 		 289 aa  175  7e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  43.25 
 
 		 283 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  39.37 
 
 		 289 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  38.46 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  43.51 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  39.79 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  34.17 
 
 		 305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.29 
 
 		 295 aa  166  4e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  40.28 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  43.8 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  42.36 
 
 		 292 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  40.5 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  36.79 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  39.07 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  36.79 
 
 		 295 aa  155  9e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  43.88 
 
 		 301 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  41.16 
 
 		 297 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.15 
 
 		 291 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  42.71 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  40.14 
 
 		 304 aa  152  5e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  39.58 
 
 		 300 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  40.79 
 
 		 297 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  40.71 
 
 		 293 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  42.51 
 
 		 293 aa  149  6e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  38.57 
 
 		 291 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  32.27 
 
 		 295 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  39.73 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  43.64 
 
 		 301 aa  142  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  36.75 
 
 		 306 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  40.17 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  35.31 
 
 		 305 aa  139  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  40.69 
 
 		 317 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  41.89 
 
 		 302 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  30.15 
 
 		 289 aa  127  2.0000000000000002e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  35.69 
 
 		 281 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 		 299 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.85 
 
 		 307 aa  117  3e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  31.01 
 
 		 319 aa  114  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 297 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  35.71 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  33.67 
 
 		 315 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  33.09 
 
 		 299 aa  99.8  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  30.39 
 
 		 296 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.93 
 
 		 287 aa  96.3  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2431  hypothetical protein  28.22 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.59 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  32.06 
 
 		 307 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 		 313 aa  91.3  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  35.51 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 287 aa  89.7  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3679  membrane protein  34.67 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  32.74 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1398  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.23 
 
 		 368 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.509319  decreased coverage  0.000513734 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.75 
 
 		 305 aa  83.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  31.34 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  33.22 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  33.22 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  33.22 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  31.58 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  36.33 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  37.05 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.61 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3356  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5011  hypothetical protein  31.54 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.878477 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  27.3 
 
 		 306 aa  75.5  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5276  hypothetical protein  32.52 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.69166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  32 
 
 		 303 aa  75.5  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  35.97 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  35.97 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>