More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_4196 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  556  1e-157  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  32.5 
 
 		 306 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  34.42 
 
 		 312 aa  103  4e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 309 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  33.1 
 
 		 312 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  32.73 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  31.39 
 
 		 293 aa  92.8  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  31.39 
 
 		 293 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.43 
 
 		 306 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  30.36 
 
 		 304 aa  89.7  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.86 
 
 		 288 aa  89.4  7e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  28.07 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.58 
 
 		 324 aa  74.7  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  29.63 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  29.63 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.84 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 290 aa  72.4  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0568  DMT superfamily drug/metabolite efflux pump  29.62 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0349448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  25.83 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  28.06 
 
 		 307 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.03 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  28.14 
 
 		 313 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  28.32 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 291 aa  67  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 340 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.46 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  26.64 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  24.81 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1754  hypothetical protein  29.86 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.302164  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  29.47 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  30.99 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  26.3 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.09 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.83 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  24.83 
 
 		 285 aa  62.8  0.000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  29.65 
 
 		 335 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  24.83 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  24.83 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  26.37 
 
 		 279 aa  62  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.3 
 
 		 330 aa  62  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  24.83 
 
 		 299 aa  62  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  22.79 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  30.63 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.11 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.45 
 
 		 303 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0610  hypothetical protein  27.8 
 
 		 349 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00052369  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.33 
 
 		 317 aa  61.6  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 		 297 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0925  hypothetical protein  24.32 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.986628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  30.18 
 
 		 318 aa  61.6  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  22.03 
 
 		 303 aa  60.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  29.49 
 
 		 308 aa  59.3  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  27.73 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  28.04 
 
 		 306 aa  58.9  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2872  hypothetical protein  29.21 
 
 		 326 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1118  hypothetical protein  29.62 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65286  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5061  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.906972  normal  0.609153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  32.09 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2817  hypothetical protein  29.21 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.813656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  29.29 
 
 		 314 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  27.7 
 
 		 318 aa  57.8  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  28.78 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.52 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  24.56 
 
 		 305 aa  57.4  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 317 aa  57.4  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3342  hypothetical protein  27.24 
 
 		 291 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0721768 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2910  hypothetical protein  28.87 
 
 		 294 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.743017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  30.05 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2245  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.11 
 
 		 300 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.108386  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  28.82 
 
 		 311 aa  57  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0518  hypothetical protein  28.37 
 
 		 293 aa  57  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  28.67 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  26.99 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 		 310 aa  56.2  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  28.36 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  20.76 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.24 
 
 		 341 aa  56.2  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  20.76 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.53 
 
 		 299 aa  56.2  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.11 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  21.07 
 
 		 296 aa  55.8  0.0000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.11 
 
 		 314 aa  55.8  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.77 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2061  hypothetical protein  29.32 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359774  normal  0.0842357 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 306 aa  55.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.11 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.53 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  25.84 
 
 		 304 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  30.04 
 
 		 314 aa  55.5  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.24 
 
 		 293 aa  55.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  26.76 
 
 		 296 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>