More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_0277 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 317 aa  603  9.999999999999999e-173  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  54.05 
 
 		 324 aa  295  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  39.25 
 
 		 314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  38.59 
 
 		 313 aa  158  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.78 
 
 		 291 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  33.68 
 
 		 309 aa  92.4  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 325 aa  87.4  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  23.16 
 
 		 303 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  22.79 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  24.54 
 
 		 303 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  22.26 
 
 		 303 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  24.16 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.55 
 
 		 288 aa  81.3  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  25.52 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  26.95 
 
 		 305 aa  80.9  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  22.79 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  23.79 
 
 		 303 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  22.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  22.79 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  22.79 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2084  hypothetical protein  32.88 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  31.05 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.29 
 
 		 322 aa  78.2  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.96 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.81 
 
 		 312 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0967  hypothetical protein  31.94 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.09 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0398  hypothetical protein  25.25 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1001  hypothetical protein  31.94 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.2 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  32.75 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.24 
 
 		 292 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  29.14 
 
 		 312 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  28.08 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  24.75 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  31.18 
 
 		 297 aa  72.4  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  27.71 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  31.05 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  31.33 
 
 		 319 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  30.85 
 
 		 293 aa  70.9  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  27.8 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.69 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.62 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28.28 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  29.77 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0391  hypothetical protein  24.18 
 
 		 330 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0667129  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  30.85 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.38 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0490  hypothetical protein  30.33 
 
 		 315 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  28.14 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  27.42 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  27.42 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  24.35 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  27.99 
 
 		 301 aa  67  0.0000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.18 
 
 		 305 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  24.84 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  24.51 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  24.51 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1448  hypothetical protein  32.26 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.802769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  24.1 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  23.55 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  24.1 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  32.24 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.77 
 
 		 301 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  32.18 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.23 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  24.1 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.87 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.32 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2469  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.91 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3927  hypothetical protein  31.25 
 
 		 303 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  23.25 
 
 		 294 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  28.15 
 
 		 293 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.08 
 
 		 302 aa  62.8  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4034  hypothetical protein  29.95 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46200  hypothetical protein  32.08 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0349407  normal  0.0243238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0526  transporter, EamA family  23.13 
 
 		 330 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.88 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4826  hypothetical protein  26.52 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2139  puative integral membrane protein  34.41 
 
 		 297 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.217486 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0439  YyaM  25.76 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1383  hypothetical protein  30.46 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22021  normal  0.350213 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  27.92 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  30.46 
 
 		 308 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  30.46 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3396  hypothetical protein  31.79 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.321335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.56 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  31.53 
 
 		 324 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.82 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.01 
 
 		 304 aa  60.8  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>