More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2802 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_2802  hypothetical protein  100 
 
 		 305 aa  584  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.930073 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.88 
 
 		 288 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  65.98 
 
 		 293 aa  352  2.9999999999999997e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  66.32 
 
 		 293 aa  332  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  66.32 
 
 		 293 aa  331  1e-89  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  62.24 
 
 		 289 aa  317  2e-85  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  57.73 
 
 		 306 aa  306  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  35.29 
 
 		 312 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  30.82 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.27 
 
 		 306 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  32.62 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 294 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.95 
 
 		 312 aa  89  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.68 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 307 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  29.37 
 
 		 307 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  27.78 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  30.58 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.69 
 
 		 306 aa  73.6  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 317 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  27.78 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  28.72 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 367 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  26.52 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 349 aa  68.9  0.00000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 289 aa  68.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0209968 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4367  hypothetical protein  26.89 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  27.87 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  28.82 
 
 		 301 aa  68.2  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.73 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  26.46 
 
 		 307 aa  67  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.08 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  31.68 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.89 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.37 
 
 		 286 aa  67  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.14 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.03 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  26.74 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  27.93 
 
 		 289 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  24.47 
 
 		 289 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.06 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  26.95 
 
 		 301 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  27.6 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.69 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  24.03 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.04 
 
 		 315 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  26.42 
 
 		 316 aa  63.9  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0572  hypothetical protein  30.11 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.638735 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0210  hypothetical protein  29.79 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000588451  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  27.24 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  29.03 
 
 		 302 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  33.87 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  28.52 
 
 		 301 aa  62.4  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  26 
 
 		 311 aa  62  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  29.75 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  28.08 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  27.4 
 
 		 304 aa  61.6  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1891  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.27 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000802295  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  25.56 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  28.51 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  27.4 
 
 		 289 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2549  EamA family protein  22.56 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0928721  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  22.18 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.82 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  22.56 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  25.63 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  27.08 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  27.24 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  27.24 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  26.09 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  22.56 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  26.88 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 293 aa  60.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.98 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  27.05 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  29.35 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000157317  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  22.06 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.67 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0515  hypothetical protein  32.43 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  22.56 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  27.78 
 
 		 287 aa  58.5  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  24.73 
 
 		 395 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  25.93 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  23.84 
 
 		 364 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  27.14 
 
 		 281 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.06 
 
 		 305 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3388  hypothetical protein  27.44 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  24.73 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3556  hypothetical protein  26.96 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.55196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4778  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.8 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.289299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 296 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  27.34 
 
 		 320 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 304 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0356674 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>