More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0643 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 290 aa  564  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.48 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.04 
 
 		 294 aa  315  7e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.76 
 
 		 290 aa  310  1e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  32.98 
 
 		 312 aa  112  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  32.03 
 
 		 312 aa  109  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.68 
 
 		 304 aa  92  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.04 
 
 		 306 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30.55 
 
 		 309 aa  88.2  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  30.42 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.6 
 
 		 293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3272  hypothetical protein  29.3 
 
 		 314 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3635  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.437202  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  26.9 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 		 292 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  29.31 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3287  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.31 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1390  DMT family permease  31.32 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.526899  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2567  hypothetical protein  28.91 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0056  hypothetical protein  31.32 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0122515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  26.81 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0335  hypothetical protein  26.71 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.414942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4196  hypothetical protein  27.37 
 
 		 293 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0314  hypothetical protein  26.51 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.52 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.78 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.78 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0352  permease, drug/metabolite transporter  27 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.110507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.24 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  28.1 
 
 		 303 aa  69.7  0.00000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.88 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 283 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  29.83 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.52 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.52 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.52 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  26.58 
 
 		 312 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.52 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.52 
 
 		 301 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4993  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.5 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.570492  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.52 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0257  DMT family permease  27 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  25.72 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0337  hypothetical protein  28.33 
 
 		 279 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.595745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 309 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  26.78 
 
 		 289 aa  66.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1245  putative permease  28.52 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.499311  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  27.93 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  22.71 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 349 aa  64.7  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0328  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.42 
 
 		 306 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0605966  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0265  hypothetical protein  25.51 
 
 		 307 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.726467  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  21.62 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1646  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.21 
 
 		 315 aa  64.7  0.000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.36 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.04 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  27.72 
 
 		 494 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  21.38 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  21.33 
 
 		 303 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  28.9 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  26.52 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  21.38 
 
 		 303 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.27 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  25.86 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0375  hypothetical protein  26.74 
 
 		 312 aa  63.2  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00512602  normal  0.079664 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  21.23 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  21.23 
 
 		 303 aa  62.8  0.000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  21.62 
 
 		 303 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  22.41 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  25.72 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  22.33 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.23 
 
 		 299 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  30.04 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  21.28 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  24.91 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  25.72 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  21.23 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  25.72 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  25.72 
 
 		 316 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  25.72 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  25.72 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.96 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  21.28 
 
 		 305 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  25 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  24.41 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  20.95 
 
 		 303 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.31 
 
 		 308 aa  60.5  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0315  hypothetical protein  27.76 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  25.99 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  26.09 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  25.99 
 
 		 400 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  25.72 
 
 		 395 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  22.18 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  26.43 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2736  eama family protein  22.18 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>