More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_3540 on replicon NC_012030
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
313 aa  581  1.0000000000000001e-165  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3137  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.9 
 
 
331 aa  319  5e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1533  protein of unknown function DUF6 transmembrane  58.67 
 
 
324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.46 
 
 
308 aa  186  4e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.09 
 
 
312 aa  181  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.61 
 
 
304 aa  177  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.22 
 
 
340 aa  169  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
367 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 
310 aa  159  4e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.1 
 
 
313 aa  153  4e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.81 
 
 
317 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.91 
 
 
306 aa  145  8.000000000000001e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.99 
 
 
315 aa  142  7e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.12 
 
 
335 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  29.18 
 
 
289 aa  92.4  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.7 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  24.92 
 
 
301 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.5 
 
 
301 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.5 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  25.85 
 
 
283 aa  82.4  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  25.51 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.85 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  27.83 
 
 
319 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.99 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.48 
 
 
274 aa  79.3  0.00000000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  27 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0672  hypothetical protein  30.94 
 
 
325 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.176077  normal  0.524236 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  30 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  29.55 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  26.24 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
296 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  26.94 
 
 
294 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2045  hypothetical protein  30 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.710395 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.32 
 
 
311 aa  75.5  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2111  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.42 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
283 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  27.38 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  27.38 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  27.38 
 
 
294 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.53 
 
 
348 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  26.74 
 
 
294 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  28.98 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
296 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1505  hypothetical protein  24.52 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  26.62 
 
 
294 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  27.4 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1542  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.15 
 
 
292 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0346  hypothetical protein  31.08 
 
 
302 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  29.05 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  27.49 
 
 
312 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  30.43 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  27 
 
 
304 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  30.04 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  35.48 
 
 
296 aa  70.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  26.24 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  26.24 
 
 
304 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  26.24 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  27.1 
 
 
295 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3198  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 
307 aa  69.7  0.00000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.12 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.39 
 
 
315 aa  69.7  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.43 
 
 
306 aa  69.3  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2114  hypothetical protein  26.39 
 
 
314 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.254514 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  30.9 
 
 
285 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.99 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  31.21 
 
 
334 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  25.86 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  27.04 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1784  hypothetical protein  27.54 
 
 
312 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0557513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  30.42 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  30.42 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  30.42 
 
 
296 aa  67  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.14 
 
 
287 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  26.47 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  28.9 
 
 
297 aa  66.2  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  26.91 
 
 
312 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  26.56 
 
 
314 aa  65.9  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  20.79 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  28.25 
 
 
306 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 
290 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  28.72 
 
 
319 aa  64.3  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  26.71 
 
 
341 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.2 
 
 
305 aa  64.7  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 
294 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
306 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2038  hypothetical protein  24.83 
 
 
301 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.174012  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7691  hypothetical protein  34.69 
 
 
299 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.327195 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0226  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0501312  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0962  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0335  DMT family permease  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.848117  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0416  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.275222  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1870  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1374  hypothetical protein  26.73 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0725871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>