162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4080 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  92.83 
 
 		 293 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  95.9 
 
 		 293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  95.56 
 
 		 293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  73.52 
 
 		 287 aa  382  1e-105  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  65.62 
 
 		 287 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  65.97 
 
 		 287 aa  299  3e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  51.93 
 
 		 293 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  50.71 
 
 		 299 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  51.75 
 
 		 295 aa  235  7e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  51.4 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  51.4 
 
 		 295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  53.31 
 
 		 298 aa  228  8e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.23 
 
 		 287 aa  226  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  49.65 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  50.35 
 
 		 293 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  50.53 
 
 		 293 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  51.06 
 
 		 312 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  51.06 
 
 		 312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  51.06 
 
 		 287 aa  212  7e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.82 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  49.66 
 
 		 288 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.11 
 
 		 294 aa  137  3.0000000000000003e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  33.22 
 
 		 295 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  35.17 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  33.69 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  35.82 
 
 		 289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.54 
 
 		 305 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.1 
 
 		 293 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.46 
 
 		 296 aa  118  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  35.56 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  36.71 
 
 		 297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  36.04 
 
 		 289 aa  114  3e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  36.65 
 
 		 306 aa  112  5e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.61 
 
 		 295 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  30.96 
 
 		 291 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  33.22 
 
 		 300 aa  108  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  33.81 
 
 		 285 aa  105  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.89 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  30.63 
 
 		 291 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.36 
 
 		 291 aa  103  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  35.82 
 
 		 298 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  35.84 
 
 		 296 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.15 
 
 		 313 aa  102  8e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  33.79 
 
 		 317 aa  102  9e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  33.33 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  30.66 
 
 		 305 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  30.42 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.24 
 
 		 299 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  36.56 
 
 		 292 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  32.33 
 
 		 308 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  31.49 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  32.03 
 
 		 293 aa  94.4  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  32.71 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  35.87 
 
 		 292 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  30.42 
 
 		 305 aa  89  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  30.24 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.92 
 
 		 299 aa  86.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  29.93 
 
 		 281 aa  85.9  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  32.43 
 
 		 304 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 		 296 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.85 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  31.85 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  30.27 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.63 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  30.56 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  26.03 
 
 		 319 aa  74.7  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  29.55 
 
 		 286 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.48 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  30.56 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  29.56 
 
 		 319 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.33 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  27.5 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  29.97 
 
 		 289 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.71 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  31.25 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 306 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.37 
 
 		 304 aa  62  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 367 aa  61.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3540  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.58 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 		 340 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  28.67 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  27.6 
 
 		 315 aa  55.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  25.95 
 
 		 289 aa  54.3  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 		 310 aa  54.7  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 335 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1799  hypothetical protein  25.9 
 
 		 310 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.76 
 
 		 320 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  28.63 
 
 		 323 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  25.44 
 
 		 309 aa  53.1  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>