205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3123 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  87.71 
 
 		 293 aa  475  1e-133  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  96.93 
 
 		 293 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  88.14 
 
 		 295 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  88.47 
 
 		 295 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  88.14 
 
 		 295 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  86.69 
 
 		 293 aa  422  1e-117  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  70.88 
 
 		 287 aa  361  9e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  74.74 
 
 		 312 aa  346  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  74.04 
 
 		 287 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  73.68 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  73.68 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  73.68 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  73.68 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  73.68 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.49 
 
 		 287 aa  286  4e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  56.43 
 
 		 299 aa  282  4.0000000000000003e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.84 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  56.03 
 
 		 298 aa  266  4e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  52.28 
 
 		 287 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  53.93 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  53.57 
 
 		 287 aa  231  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  49.3 
 
 		 293 aa  218  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  57.25 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.89 
 
 		 294 aa  109  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  34.25 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  33.81 
 
 		 298 aa  104  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.64 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.5 
 
 		 307 aa  99  9e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.3 
 
 		 313 aa  99  9e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 293 aa  97.4  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.09 
 
 		 305 aa  95.5  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  38.28 
 
 		 292 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.55 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.69 
 
 		 295 aa  92.8  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.68 
 
 		 305 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  35.66 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  33.91 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  33.45 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  35.4 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 		 295 aa  89.4  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  35.12 
 
 		 306 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  31.23 
 
 		 307 aa  87  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  30.3 
 
 		 291 aa  86.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  31.53 
 
 		 291 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.67 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  34.97 
 
 		 297 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 291 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.02 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  29.71 
 
 		 285 aa  82  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.51 
 
 		 283 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  37.88 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.69 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.44 
 
 		 299 aa  79  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  31.21 
 
 		 308 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32 
 
 		 306 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  28.52 
 
 		 299 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  33.57 
 
 		 286 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  32.07 
 
 		 289 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  31.62 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  33.57 
 
 		 281 aa  72.8  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  31.12 
 
 		 296 aa  72.4  0.000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  29.49 
 
 		 305 aa  72.4  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.33 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.01 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  31.72 
 
 		 325 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  31.02 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  30.9 
 
 		 291 aa  67  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  30 
 
 		 315 aa  67  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  28.52 
 
 		 312 aa  67  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29 
 
 		 299 aa  67  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 290 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 296 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  31.97 
 
 		 307 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  25.84 
 
 		 319 aa  63.9  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.26 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.27 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  30.31 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  29.97 
 
 		 289 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.48 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  29.43 
 
 		 302 aa  58.9  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.18 
 
 		 320 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.5 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  27.53 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.92 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  30.91 
 
 		 289 aa  57  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0406  hypothetical protein  29.69 
 
 		 306 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.09 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 302 aa  55.8  0.0000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  31.94 
 
 		 312 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.49 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  29.64 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  28.77 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>