201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_2986 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  86.69 
 
 		 293 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  86.78 
 
 		 295 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  87.12 
 
 		 295 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  86.78 
 
 		 295 aa  456  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  96.93 
 
 		 293 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  87.03 
 
 		 293 aa  426  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  71.28 
 
 		 287 aa  360  2e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  75.18 
 
 		 312 aa  346  2e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  74.47 
 
 		 287 aa  343  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  74.11 
 
 		 287 aa  342  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  74.11 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  74.11 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  74.11 
 
 		 287 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  74.11 
 
 		 312 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  57.5 
 
 		 299 aa  289  4e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  56.84 
 
 		 287 aa  286  2.9999999999999996e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  57.8 
 
 		 298 aa  273  4.0000000000000004e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.19 
 
 		 287 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  52.84 
 
 		 287 aa  251  1e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  53.93 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  54.29 
 
 		 287 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  48.94 
 
 		 293 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  56.74 
 
 		 288 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  50.7 
 
 		 293 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  50.35 
 
 		 293 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.75 
 
 		 294 aa  109  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  33.68 
 
 		 289 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  36.75 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.6 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  33.81 
 
 		 298 aa  102  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  30.85 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.04 
 
 		 305 aa  96.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.94 
 
 		 293 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 295 aa  93.6  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  37.59 
 
 		 292 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  27.14 
 
 		 305 aa  92.4  8e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.63 
 
 		 305 aa  92  1e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.6 
 
 		 313 aa  91.7  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  34.38 
 
 		 317 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  32.63 
 
 		 300 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  35.79 
 
 		 297 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  35.04 
 
 		 298 aa  90.1  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  34.95 
 
 		 306 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  32.52 
 
 		 307 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  32.2 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  30.51 
 
 		 291 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  30.07 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  28.67 
 
 		 295 aa  83.2  0.000000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  35.09 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.8 
 
 		 291 aa  82.8  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  32.86 
 
 		 283 aa  82.4  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.55 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  35.69 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  33.9 
 
 		 286 aa  79.3  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  37.33 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 299 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  32.12 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  29.24 
 
 		 299 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  32.72 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  32.87 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  31.32 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  32.42 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  34.27 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.01 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  31.56 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  31.8 
 
 		 289 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.8 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  33.8 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.421742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 		 296 aa  70.1  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.52 
 
 		 325 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  28.38 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  31.83 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  29.39 
 
 		 315 aa  68.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.39 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  25.61 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.49 
 
 		 312 aa  65.9  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5166  hypothetical protein  31.1 
 
 		 289 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.058561 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3631  hypothetical protein  31.02 
 
 		 307 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4637  hypothetical protein  30.74 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  30.14 
 
 		 302 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  26.57 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.6 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.95 
 
 		 296 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.07 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  27.7 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  25.54 
 
 		 311 aa  57.4  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4132  hypothetical protein  31.52 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.507718  hitchhiker  0.00000080806 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.99 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.06 
 
 		 367 aa  55.8  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  29.47 
 
 		 291 aa  55.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2873  hypothetical protein  29.36 
 
 		 298 aa  55.5  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.604973  normal  0.0800404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.62 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  32.83 
 
 		 312 aa  54.7  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.48 
 
 		 302 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4424  hypothetical protein  29.52 
 
 		 307 aa  53.9  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00325895 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.49 
 
 		 320 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>