198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0218 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0218  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2158  hypothetical protein  99.04 
 
 
312 aa  578  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3268  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  527  1e-149  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0402  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  527  1e-149  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2931  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  527  1e-149  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3416  hypothetical protein  98.95 
 
 
287 aa  527  1e-149  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.824806  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0206  hypothetical protein  98.61 
 
 
287 aa  525  1e-148  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0180  hypothetical protein  90.59 
 
 
287 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6425  hypothetical protein  75.53 
 
 
293 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.830859 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2461  hypothetical protein  78.17 
 
 
295 aa  385  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.33981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3093  hypothetical protein  77.82 
 
 
295 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.622922 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3075  hypothetical protein  78.17 
 
 
295 aa  384  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3072  hypothetical protein  76.49 
 
 
293 aa  355  3.9999999999999996e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.727288 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2986  hypothetical protein  75.18 
 
 
293 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0531098 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3123  hypothetical protein  74.74 
 
 
293 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3624  protein of unknown function DUF6 transmembrane  60.55 
 
 
287 aa  293  2e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  61.25 
 
 
287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5253  hypothetical protein  57.45 
 
 
299 aa  277  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5922  hypothetical protein  58.7 
 
 
298 aa  271  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1416  hypothetical protein  50 
 
 
287 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3991  hypothetical protein  51.06 
 
 
287 aa  223  4e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.244983  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29070  hypothetical protein  50.71 
 
 
287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286687 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3244  hypothetical protein  57.14 
 
 
288 aa  218  7e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3869  hypothetical protein  49.47 
 
 
293 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.751043  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4568  hypothetical protein  50.35 
 
 
293 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4080  hypothetical protein  51.06 
 
 
293 aa  207  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1321  hypothetical protein  50.35 
 
 
293 aa  208  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1785  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.71 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3854  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 
293 aa  109  6e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2246  hypothetical protein  35.36 
 
 
300 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.167542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5624  hypothetical protein  37.11 
 
 
296 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.353351  normal  0.158728 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1957  putative transmembrane protein  37.91 
 
 
298 aa  105  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.380299  normal  0.749824 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1940  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.1 
 
 
305 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0530229  hitchhiker  0.00250027 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1612  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.66 
 
 
305 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0142876  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1607  hypothetical protein  33.45 
 
 
307 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00020661  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2766  hypothetical protein  34.05 
 
 
289 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.393161  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4574  hypothetical protein  38.52 
 
 
296 aa  99  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.252933  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1003  hypothetical protein  32.01 
 
 
285 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1629  hypothetical protein  38.01 
 
 
306 aa  97.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1772  hypothetical protein  39.72 
 
 
292 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06857  hypothetical protein  29.7 
 
 
305 aa  95.5  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1958  hypothetical protein  34.51 
 
 
286 aa  94  3e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0226422 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0738  hypothetical protein  31.92 
 
 
295 aa  94  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1083  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.99 
 
 
295 aa  93.2  4e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.427238  normal  0.445197 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5135  hypothetical protein  36.56 
 
 
297 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.382193 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4003  membrane protein  30.39 
 
 
307 aa  91.3  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0116416  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  35.23 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3074  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.41 
 
 
313 aa  90.5  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.526494  normal  0.199579 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1930  hypothetical protein  34.95 
 
 
317 aa  89  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0562789 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4064  hypothetical protein  33.93 
 
 
283 aa  88.6  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20640  hypothetical protein  38.33 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14869  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2902  hypothetical protein  33.71 
 
 
298 aa  87  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  35.71 
 
 
297 aa  86.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  37.55 
 
 
293 aa  86.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2505  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 
307 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.017863  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2362  hypothetical protein  33.56 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.483253  normal  0.469828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0009  hypothetical protein  37.24 
 
 
289 aa  85.9  9e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4510  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.67 
 
 
296 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.444897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3591  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.91 
 
 
291 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0946  integral membrane protein  31.56 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0455522  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2229  hypothetical protein  37.14 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.547025 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3100  hypothetical protein  31.99 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  decreased coverage  0.00425417 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3027  hypothetical protein  36.56 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.810081  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4991  hypothetical protein  34.51 
 
 
289 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0136  hypothetical protein  34.04 
 
 
308 aa  80.1  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3358  hypothetical protein  34.04 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157803  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5277  hypothetical protein  33.45 
 
 
289 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000880  permease  31.84 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4786  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
290 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22044  hitchhiker  0.0000243814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2187  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.23 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.397881  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4358  hypothetical protein  31.82 
 
 
281 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.819513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1987  hypothetical protein  33.56 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.1262 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3229  hypothetical protein  30.66 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0176714  hitchhiker  0.00000979467 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.58 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4348  hypothetical protein  33.93 
 
 
302 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663003  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0373  hypothetical protein  32.92 
 
 
325 aa  67  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.72198  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  28.27 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4483  hypothetical protein  28.37 
 
 
305 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2165  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.82 
 
 
299 aa  65.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4880  hypothetical protein  30.56 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00223528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.57 
 
 
312 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3950  hypothetical protein  31.14 
 
 
305 aa  63.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.395543  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 
323 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2899  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 
299 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.754555  normal  0.48327 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0878  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.754226  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3444  hypothetical protein  32.63 
 
 
291 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0762  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.42 
 
 
297 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0587  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.256755  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0697  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.157594  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1652  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.755611  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0514  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317548  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2100  hypothetical protein  32.31 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.265012  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.7 
 
 
305 aa  59.3  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00175319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0659  hypothetical protein  28.77 
 
 
307 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.19806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4718  drug/metabolite transporter (DMT) superfamily permease  31.75 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2005  hypothetical protein  32.17 
 
 
301 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0052  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.55 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175187  normal  0.588474 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  28.72 
 
 
296 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0887  hypothetical protein  31.32 
 
 
301 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>