46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2550 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 338 aa  640    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 		 321 aa  129  7.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.470306 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.37 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  28.83 
 
 		 297 aa  55.8  0.000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15760  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  28.76 
 
 		 327 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.941518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  29.18 
 
 		 312 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 301 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.08 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  32.07 
 
 		 291 aa  50.8  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4402  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.4 
 
 		 335 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.35 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  24.43 
 
 		 308 aa  49.7  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  35.4 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0808  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.58 
 
 		 324 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  35.4 
 
 		 314 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  35.29 
 
 		 304 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0752  hypothetical protein  24.43 
 
 		 308 aa  48.5  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0896915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0313  hypothetical protein  26.81 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00423345 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.67 
 
 		 367 aa  47.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0168  hypothetical protein  25.22 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  27.03 
 
 		 300 aa  47  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1606  hypothetical protein  37.65 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  26.99 
 
 		 297 aa  46.6  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 296 aa  45.8  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  33.87 
 
 		 287 aa  45.8  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.6 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.64 
 
 		 348 aa  45.8  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  29.11 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  29.38 
 
 		 301 aa  45.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  28.91 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  31.25 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.31 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  29.35 
 
 		 297 aa  43.9  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4527  hypothetical protein  28.76 
 
 		 308 aa  43.5  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.5 
 
 		 301 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4193  hypothetical protein  30.77 
 
 		 274 aa  43.1  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.582815  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1316  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 355 aa  42.7  0.009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00217359 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.89 
 
 		 304 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>