263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3614 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3614  integral membrane protein  100 
 
 		 321 aa  630  1e-180  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3095  integral membrane protein  47.95 
 
 		 294 aa  246  3e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.194858  normal  0.101185 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2545  integral membrane protein  45.04 
 
 		 308 aa  222  8e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.723869 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  37.25 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 297 aa  80.1  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  25.17 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3552  hypothetical protein  27.72 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.963369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.82 
 
 		 293 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  26.91 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  24.48 
 
 		 293 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.83 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  25.87 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  25.52 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.93 
 
 		 278 aa  67  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 293 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1174  hypothetical protein  24.65 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0657223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  24.67 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.76 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  22.92 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.53 
 
 		 287 aa  62.4  0.000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  26.3 
 
 		 308 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  25.91 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  24.67 
 
 		 294 aa  62.4  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5303  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.46 
 
 		 307 aa  61.2  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73277  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.17 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  26.71 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  24 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 		 293 aa  61.6  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.26 
 
 		 292 aa  60.8  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  26.96 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  24.05 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1338  integral membrane protein  28.16 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3485  hypothetical protein  23.29 
 
 		 318 aa  59.7  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  22.9 
 
 		 288 aa  59.3  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  24.62 
 
 		 300 aa  59.3  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  27.54 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  26.79 
 
 		 304 aa  58.9  0.0000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0442  hypothetical protein  27.63 
 
 		 302 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  25.4 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.63 
 
 		 312 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  29.87 
 
 		 303 aa  57  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  26.98 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0453  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.66 
 
 		 288 aa  55.5  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000315888  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  28.91 
 
 		 299 aa  55.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  22.94 
 
 		 292 aa  55.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  27.44 
 
 		 309 aa  54.3  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0039  hypothetical protein  25 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0226  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.39 
 
 		 273 aa  55.1  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2958  hypothetical protein  24.52 
 
 		 301 aa  55.1  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  28.08 
 
 		 304 aa  54.3  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  26.22 
 
 		 299 aa  54.3  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.27 
 
 		 318 aa  53.9  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  23.17 
 
 		 292 aa  53.5  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0006  DMT family permease  25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  21.92 
 
 		 311 aa  53.9  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1636  hypothetical protein  25 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.3725 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.29 
 
 		 301 aa  53.5  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07041  integral membrane protein, DUF6  27.62 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0828931  normal  0.114076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2488  hypothetical protein  26.82 
 
 		 304 aa  53.1  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.26 
 
 		 313 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  22.59 
 
 		 307 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  25.28 
 
 		 343 aa  52.8  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1241  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.75 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.608895  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  28.02 
 
 		 301 aa  52.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  22.36 
 
 		 298 aa  52.4  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  52.8  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4295  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 313 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4405  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.91 
 
 		 300 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.878991 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  24.01 
 
 		 306 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2929  hypothetical protein  30.3 
 
 		 313 aa  52  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30130  hypothetical protein  26.54 
 
 		 296 aa  52  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.82 
 
 		 301 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  24.83 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  24.91 
 
 		 343 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 306 aa  51.6  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  25.28 
 
 		 512 aa  51.2  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2163  hypothetical protein  23.75 
 
 		 295 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.622252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2410  hypothetical protein  27.88 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.116098  normal  0.54382 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4940  hypothetical protein  25.41 
 
 		 304 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.234076  normal  0.439093 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  21.35 
 
 		 294 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.17 
 
 		 310 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0778  hypothetical protein  22.8 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2579  hypothetical protein  26.54 
 
 		 294 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.27497  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0054  integral membrane protein  25.15 
 
 		 297 aa  50.4  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2983  hypothetical protein  25.29 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2962  hypothetical protein  25.29 
 
 		 300 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.176802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23.01 
 
 		 294 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.82 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.177325 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  27.5 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.24 
 
 		 317 aa  50.1  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1712  hypothetical protein  29.3 
 
 		 277 aa  49.7  0.00006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000911323 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15881  integral membrane protein, DUF6  23.21 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>