104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0218 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  100 
 
 		 320 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  588  1e-167  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.11 
 
 		 315 aa  378  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  72.38 
 
 		 307 aa  323  2e-87  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.72 
 
 		 293 aa  186  5e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  31.72 
 
 		 287 aa  169  6e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  31.46 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.9 
 
 		 296 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.67 
 
 		 289 aa  152  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 		 301 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  28.91 
 
 		 296 aa  146  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.51 
 
 		 315 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  32.01 
 
 		 293 aa  108  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  28.16 
 
 		 293 aa  106  7e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  28.91 
 
 		 294 aa  105  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  28.16 
 
 		 293 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  28.16 
 
 		 293 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  27.01 
 
 		 297 aa  101  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.53 
 
 		 293 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  29.93 
 
 		 290 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  27.85 
 
 		 292 aa  96.7  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  32.05 
 
 		 296 aa  89.7  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  29.08 
 
 		 298 aa  86.3  7e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  28.46 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  28.47 
 
 		 294 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  27.02 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  28.14 
 
 		 294 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  31.58 
 
 		 299 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.24 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  31.48 
 
 		 309 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.29 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  26.69 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 317 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  28.08 
 
 		 315 aa  73.9  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  31.82 
 
 		 145 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.84 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  29.95 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  30.43 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  23.78 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  25.51 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.22 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  25.86 
 
 		 309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  25.86 
 
 		 309 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  28.16 
 
 		 295 aa  53.1  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  29.25 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.39 
 
 		 295 aa  52  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  24.75 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  22.26 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0774  hypothetical protein  29.11 
 
 		 321 aa  49.7  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.834381  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  26.94 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.6 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  30.94 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  26.9 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.174107  normal  0.924081 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.51 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  26.6 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  26.6 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2752  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.86 
 
 		 309 aa  47  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  46.6  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  31.02 
 
 		 296 aa  46.2  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  25.62 
 
 		 347 aa  46.2  0.0007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.45 
 
 		 308 aa  46.2  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0301  hypothetical protein  24.16 
 
 		 341 aa  46.2  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.07 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.09 
 
 		 301 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  24.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  24.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  29.84 
 
 		 402 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  29.6 
 
 		 321 aa  45.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  29.46 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  25 
 
 		 304 aa  45.8  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  24.09 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 		 292 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.38 
 
 		 330 aa  45.8  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  29.46 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  29.46 
 
 		 356 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 311 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.273134 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  24.22 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4387  EamA family protein  25.38 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  24.09 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4228  drug/metabolite exporter family protein  23.1 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  25.38 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  22.22 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4726  eama family protein  25.38 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  24.09 
 
 		 301 aa  44.3  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4605  transporter, EamA family  25.38 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1015  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 297 aa  44.3  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.604771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.31 
 
 		 321 aa  43.9  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4331  hypothetical protein  24.22 
 
 		 316 aa  43.9  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  32.14 
 
 		 327 aa  43.9  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0356  transporter, EamA family  24.23 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  29.05 
 
 		 356 aa  43.5  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  29.37 
 
 		 325 aa  43.5  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.59 
 
 		 293 aa  43.5  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>