74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_04828 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  100 
 
 		 307 aa  593  1e-168  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  79.68 
 
 		 315 aa  364  1e-99  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  72.38 
 
 		 320 aa  301  8.000000000000001e-81  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  72.38 
 
 		 304 aa  300  2e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.72 
 
 		 293 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  31.56 
 
 		 287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.92 
 
 		 296 aa  138  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.38 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  32.44 
 
 		 309 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  33.04 
 
 		 296 aa  123  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.51 
 
 		 301 aa  116  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.14 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  27.35 
 
 		 297 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  31.03 
 
 		 293 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  30.6 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  32.84 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  30.04 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  28.57 
 
 		 292 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  29.26 
 
 		 298 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  29.61 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  29.61 
 
 		 293 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.32 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.18 
 
 		 293 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  30.49 
 
 		 283 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  29.49 
 
 		 294 aa  72  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  28.74 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  28.49 
 
 		 296 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  25.93 
 
 		 288 aa  70.5  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  29.53 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  28.46 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  28.63 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  30.47 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  31.39 
 
 		 287 aa  64.3  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.38 
 
 		 293 aa  63.5  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  26.6 
 
 		 274 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.76 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.03 
 
 		 310 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  31.4 
 
 		 145 aa  52.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.16 
 
 		 310 aa  52  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  28.92 
 
 		 309 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  28.7 
 
 		 290 aa  51.2  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.7 
 
 		 325 aa  51.2  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  33.68 
 
 		 296 aa  50.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.15 
 
 		 293 aa  50.1  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4244  PecM protein  31.13 
 
 		 335 aa  50.1  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0960699 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  28.76 
 
 		 291 aa  49.7  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3336  hypothetical protein  34.65 
 
 		 325 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.547457  normal  0.396992 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  26.38 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  29.36 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.09 
 
 		 289 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  29.36 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  29.36 
 
 		 309 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.52 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  22.82 
 
 		 317 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  26.2 
 
 		 296 aa  47  0.0004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  27.16 
 
 		 297 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.97 
 
 		 302 aa  46.2  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 		 301 aa  45.4  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  25.24 
 
 		 308 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  29.15 
 
 		 299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  25.11 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  28.25 
 
 		 397 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  28.9 
 
 		 309 aa  43.5  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  29.47 
 
 		 319 aa  43.5  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  29.63 
 
 		 282 aa  42.7  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.85 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03168  permease of the drug/metabolite transporter  25.36 
 
 		 347 aa  42.7  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11064  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.07 
 
 		 321 aa  42.7  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  26.11 
 
 		 311 aa  42.4  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2821  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.86 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.499218  normal  0.67078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>