75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0588.2 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  100 
 
 		 145 aa  282  1.0000000000000001e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  93.7 
 
 		 294 aa  238  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  85.71 
 
 		 293 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  86.43 
 
 		 293 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  85 
 
 		 293 aa  234  2e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  85 
 
 		 293 aa  234  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  79.72 
 
 		 294 aa  227  4e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  94.49 
 
 		 294 aa  226  9e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  93.7 
 
 		 294 aa  225  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  75.36 
 
 		 292 aa  207  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  71.83 
 
 		 296 aa  197  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  69.23 
 
 		 297 aa  190  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  73.91 
 
 		 292 aa  187  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  69.92 
 
 		 293 aa  187  5e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  63.64 
 
 		 290 aa  186  8e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  55.73 
 
 		 288 aa  150  8e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  56.62 
 
 		 298 aa  147  4e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  50.36 
 
 		 291 aa  127  6e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  45.86 
 
 		 293 aa  109  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 		 282 aa  83.6  8e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.43 
 
 		 296 aa  77  0.00000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  31.82 
 
 		 320 aa  73.6  0.0000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  31.82 
 
 		 304 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.87 
 
 		 315 aa  70.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  32.59 
 
 		 299 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  29.63 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  33.33 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  33.61 
 
 		 297 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  24.24 
 
 		 287 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  29.29 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.14 
 
 		 293 aa  58.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  26.9 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  26.15 
 
 		 296 aa  57.4  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  24.8 
 
 		 287 aa  57.4  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 		 289 aa  55.1  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  34.88 
 
 		 296 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  29.41 
 
 		 283 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 301 aa  53.5  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  31.4 
 
 		 307 aa  52.8  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0971  hypothetical protein  28.68 
 
 		 296 aa  53.1  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0379248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.48 
 
 		 300 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  25.56 
 
 		 289 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  34.33 
 
 		 296 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 		 315 aa  51.2  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  25.55 
 
 		 281 aa  50.8  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1463  hypothetical protein  30.37 
 
 		 304 aa  50.4  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  22.48 
 
 		 300 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  22.48 
 
 		 300 aa  50.1  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  22.48 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  22.48 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.48 
 
 		 302 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  25 
 
 		 311 aa  48.9  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 		 317 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3873  hypothetical protein  33.61 
 
 		 298 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.28 
 
 		 312 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 		 301 aa  47.8  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4307  hypothetical protein  32.77 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1560  hypothetical protein  32.77 
 
 		 307 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 329 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  34.51 
 
 		 296 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2490  hypothetical protein  29.92 
 
 		 298 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.451332  normal  0.251301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3634  hypothetical protein  30.25 
 
 		 298 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  27.01 
 
 		 313 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  24.79 
 
 		 307 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.77 
 
 		 293 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.32 
 
 		 278 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4824  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.8 
 
 		 306 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00452442  normal  0.0267475 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0160  hypothetical protein  27.94 
 
 		 299 aa  42.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  27.64 
 
 		 290 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  25.18 
 
 		 306 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  30.7 
 
 		 299 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  31.36 
 
 		 273 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 		 302 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.64 
 
 		 296 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>