84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0043 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  585  1e-166  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  55.59 
 
 		 309 aa  316  3e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.32 
 
 		 296 aa  243  3e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.5 
 
 		 315 aa  176  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.81 
 
 		 293 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  30.47 
 
 		 287 aa  143  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 315 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.96 
 
 		 301 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  30.48 
 
 		 320 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  30.48 
 
 		 304 aa  135  9e-31  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.82 
 
 		 289 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  32.6 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  27.24 
 
 		 293 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  26.91 
 
 		 293 aa  97.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  26.1 
 
 		 292 aa  97.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.16 
 
 		 282 aa  96.7  4e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.58 
 
 		 293 aa  96.3  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  26.58 
 
 		 293 aa  95.9  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  26.51 
 
 		 297 aa  92.8  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  24.92 
 
 		 288 aa  88.6  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  24.5 
 
 		 293 aa  89  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  27.08 
 
 		 290 aa  86.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.53 
 
 		 294 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  26.62 
 
 		 294 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  26.16 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  22.78 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  24.66 
 
 		 293 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  26.62 
 
 		 309 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25.97 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  24.49 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  26.78 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  24.65 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  27.39 
 
 		 295 aa  60.5  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  24.66 
 
 		 297 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  23.21 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  24.55 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.25 
 
 		 301 aa  57.8  0.0000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  26.15 
 
 		 145 aa  57.4  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1224  EamA family protein  22.96 
 
 		 289 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.1 
 
 		 317 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1281  permease, drug/metabolite transporter superfamily  23.22 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.232405  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  24.07 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.18 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1025  transport protein; drug/metabolite exporter  22.22 
 
 		 300 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00291899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1126  eama family protein  22.81 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1047  EamA family protein  22.81 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000195786  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1022  transport protein; drug/metabolite exporter  22.81 
 
 		 300 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.506824  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1204  permease, drug/metabolite transporter superfamily  22.22 
 
 		 302 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.717476 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0035  hypothetical protein  23.47 
 
 		 300 aa  50.1  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5563  hypothetical protein  22.22 
 
 		 311 aa  49.3  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.136862  hitchhiker  0.00720302 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1031  hypothetical protein  34.04 
 
 		 307 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0574  hypothetical protein  22.57 
 
 		 308 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.421422  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0259  drug/metabolite exporter  26.21 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0455861  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  23.37 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0986  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  32.98 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1029  hypothetical protein  23.62 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0850  hypothetical protein  22.12 
 
 		 307 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2916  DMT family permease  22.22 
 
 		 297 aa  47  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.261438 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2929  DMT family permease  29.79 
 
 		 298 aa  46.6  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0171282  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.52 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  23.97 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5090  hypothetical protein  25.75 
 
 		 307 aa  45.4  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.194809  normal  0.0140686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0003  hypothetical protein  28.07 
 
 		 288 aa  45.1  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0184186  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  25 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3212  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  33.33 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2759  hypothetical protein  20.44 
 
 		 298 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.89 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 323 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  21.82 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  21.95 
 
 		 319 aa  43.5  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05230  predicted permease, DMT superfamily  20.86 
 
 		 291 aa  43.5  0.004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.927028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02797  hypothetical protein  25.86 
 
 		 315 aa  43.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.605573  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1839  DMT family permease  23.22 
 
 		 306 aa  43.1  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255107  normal  0.316486 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2651  hypothetical protein  20.07 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.574566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1098  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.01 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.15622  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0349  hypothetical protein  21.35 
 
 		 343 aa  42.7  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3621  hypothetical protein  26.87 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0361  hypothetical protein  21.35 
 
 		 343 aa  42.7  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1055  hypothetical protein  24.12 
 
 		 296 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4207  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.33 
 
 		 313 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0539  hypothetical protein  21.35 
 
 		 512 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.44967  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  25 
 
 		 308 aa  42.4  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>