85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_5563 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_5563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 301 aa  593  1e-169  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  57.09 
 
 		 289 aa  318  9e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000287238 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4038  hypothetical protein  55.24 
 
 		 287 aa  311  1e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2338  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.89 
 
 		 293 aa  304  1.0000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0424523  normal  0.230999 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.51 
 
 		 296 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.296277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0043  hypothetical protein  31.96 
 
 		 296 aa  146  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.355426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0190  hypothetical protein  34.19 
 
 		 304 aa  142  5e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0218  hypothetical protein  34.19 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1231  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 		 315 aa  141  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.122413 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00855  predicted permease  31.34 
 
 		 309 aa  138  1e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04828  integral membrane protein DUF6  35.48 
 
 		 307 aa  114  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1095  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.74 
 
 		 282 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000428638  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2955  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.93 
 
 		 315 aa  99  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.65096  normal  0.735027 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3035  membrane protein  30.41 
 
 		 293 aa  95.9  8e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.39901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0548  hypothetical protein  28.14 
 
 		 293 aa  89  8e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0438907  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1904  RhaT protein  27.92 
 
 		 299 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.304743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3903  hypothetical protein  27.46 
 
 		 293 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3320  hypothetical protein  25.77 
 
 		 290 aa  86.3  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000781586  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3484  hypothetical protein  25.08 
 
 		 288 aa  86.3  6e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.590358  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3777  hypothetical protein  27.8 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3514  membrane protein  25.26 
 
 		 298 aa  81.6  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3290  hypothetical protein  26.21 
 
 		 294 aa  82  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3550  hypothetical protein  23.75 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.582499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0980  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 317 aa  79.3  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.141958  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1473  hypothetical protein  26.92 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.639422  normal  0.112426 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0556  hypothetical protein  26.61 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.122982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2245  hypothetical protein  25.71 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.891257 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0787  hypothetical protein  24.64 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0809288  hitchhiker  0.000526282 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0588  hypothetical protein  26.96 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0107806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1818  hypothetical protein  26.94 
 
 		 283 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.264733  normal  0.803156 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00548  membrane protein  25.34 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480438  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22560  putative permease  29.23 
 
 		 297 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000360321  hitchhiker  0.0000288178 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  26.29 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0587  hypothetical protein  25.85 
 
 		 294 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0117483 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4181  hypothetical protein  22.59 
 
 		 297 aa  63.2  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3442  hypothetical protein  25.94 
 
 		 294 aa  62.8  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4512  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.810573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1399  hypothetical protein  26.99 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.137527  normal  0.630416 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3801  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000662683 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  23.59 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0588.2  DMT family permease  25.19 
 
 		 145 aa  55.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.33 
 
 		 302 aa  52.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  24.84 
 
 		 303 aa  50.4  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  24.2 
 
 		 315 aa  49.7  0.00006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2339  hypothetical protein  28.37 
 
 		 337 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0842181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  22.38 
 
 		 302 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  24.42 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0189  hypothetical protein  25.22 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  34.58 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.51 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4018  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00321075 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  23.25 
 
 		 303 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6325  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.29 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0999573  normal  0.0472639 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  22.06 
 
 		 310 aa  46.6  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1197  hypothetical protein  24.62 
 
 		 310 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.575187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  24.51 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  24.09 
 
 		 292 aa  45.8  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.18 
 
 		 283 aa  45.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  24.18 
 
 		 303 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  24.38 
 
 		 305 aa  45.4  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.05 
 
 		 287 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  22.03 
 
 		 296 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  23.93 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  23 
 
 		 303 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  25.7 
 
 		 302 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.05 
 
 		 300 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2616  hypothetical protein  24.25 
 
 		 310 aa  44.3  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0513326  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  23.59 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23190  predicted permease  21.38 
 
 		 287 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0147782 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.56 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000242162  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  23.38 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2461  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.27 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.508316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1193  DMT superfamily efflux pump  24.23 
 
 		 310 aa  43.5  0.004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.516165 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0929  hypothetical protein  24 
 
 		 292 aa  43.5  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4920  EamA family protein  24.1 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.09 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.271301 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  22.68 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  22.68 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  22.68 
 
 		 303 aa  42.7  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.37 
 
 		 321 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  26.36 
 
 		 297 aa  42.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4504  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.26 
 
 		 348 aa  42.4  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2726  hypothetical protein  25.68 
 
 		 286 aa  42.4  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.054013  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.9 
 
 		 310 aa  42.4  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>