46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0922 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  100 
 
 		 309 aa  582  1.0000000000000001e-165  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  55.04 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  48.98 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  46 
 
 		 313 aa  185  8e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.67 
 
 		 313 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  49.47 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.66 
 
 		 296 aa  179  5.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  47.62 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  46.36 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  48.11 
 
 		 302 aa  157  3e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  34.98 
 
 		 333 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  34.01 
 
 		 301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  36.04 
 
 		 313 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  35.71 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  35.39 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  35.39 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  37.09 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  35.39 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  30.79 
 
 		 288 aa  109  5e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  34.32 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  30.67 
 
 		 284 aa  107  3e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.53 
 
 		 331 aa  106  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  34.19 
 
 		 313 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  34.41 
 
 		 328 aa  105  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.39 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  31.82 
 
 		 315 aa  101  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  35.91 
 
 		 306 aa  100  4e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  35.53 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  35.53 
 
 		 249 aa  95.9  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.05 
 
 		 306 aa  95.9  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  32.68 
 
 		 315 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  31.61 
 
 		 329 aa  89.7  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  32.78 
 
 		 825 aa  88.6  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  31.17 
 
 		 315 aa  87.4  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  31.17 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  31.17 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  31.17 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.63 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03280  predicted permease, DMT superfamily  35.66 
 
 		 309 aa  52.8  0.000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2545  hypothetical protein  34.74 
 
 		 299 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.281765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18490  DMT family transporter: drug/metabolite  29.09 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00171701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19920  predicted permease, DMT superfamily  33.72 
 
 		 331 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.185467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0322  putative permease of the drug/metabolite transporter  36.9 
 
 		 311 aa  44.3  0.003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.806921  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000272  permease  23.14 
 
 		 301 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  43.1  0.006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>