51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_2593 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  100 
 
 		 825 aa  1564    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  99.05 
 
 		 315 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  98.73 
 
 		 315 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  98.73 
 
 		 315 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  98.73 
 
 		 315 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  98.41 
 
 		 315 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  98.41 
 
 		 315 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  95.08 
 
 		 329 aa  536  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  77.3 
 
 		 313 aa  480  1e-134  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  77.3 
 
 		 313 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  77.3 
 
 		 338 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  77.3 
 
 		 313 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  77.63 
 
 		 313 aa  477  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  77.3 
 
 		 338 aa  477  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  78.62 
 
 		 313 aa  474  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  67.82 
 
 		 333 aa  430  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  70.07 
 
 		 331 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  68.98 
 
 		 331 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  49.13 
 
 		 341 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.18 
 
 		 306 aa  239  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50 
 
 		 306 aa  238  3e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  49.15 
 
 		 306 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  42.43 
 
 		 301 aa  202  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  39.06 
 
 		 328 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  36.3 
 
 		 304 aa  120  9e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  35.17 
 
 		 299 aa  119  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.18 
 
 		 296 aa  111  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  34.43 
 
 		 309 aa  108  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  37.28 
 
 		 309 aa  99.4  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  33.48 
 
 		 249 aa  97.8  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  33.48 
 
 		 249 aa  97.8  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  29.81 
 
 		 313 aa  87.4  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.19 
 
 		 311 aa  87  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.81 
 
 		 313 aa  86.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  40.77 
 
 		 264 aa  85.1  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  35.08 
 
 		 302 aa  82  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  33.47 
 
 		 312 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.93 
 
 		 288 aa  76.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  28.47 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  33.82 
 
 		 290 aa  60.1  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  33.33 
 
 		 402 aa  55.1  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  33.66 
 
 		 309 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  33.17 
 
 		 309 aa  53.5  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  32.2 
 
 		 397 aa  51.6  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  48.1  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  32.51 
 
 		 309 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  33.77 
 
 		 356 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  33.77 
 
 		 356 aa  44.3  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0102  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 289 aa  44.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.734078 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>