53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_1929 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  600  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  98.72 
 
 		 313 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  94.89 
 
 		 313 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  94.57 
 
 		 338 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  94.57 
 
 		 338 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  94.25 
 
 		 313 aa  570  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  90.42 
 
 		 313 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  76.97 
 
 		 315 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  77.3 
 
 		 825 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  67.09 
 
 		 333 aa  431  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  76.97 
 
 		 315 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  76.64 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  76.64 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  76.64 
 
 		 315 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  78.29 
 
 		 329 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  76.32 
 
 		 315 aa  419  1e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  66.77 
 
 		 331 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  63.75 
 
 		 331 aa  387  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.59 
 
 		 306 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.94 
 
 		 306 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  47.78 
 
 		 341 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  48.42 
 
 		 306 aa  233  2.0000000000000002e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  43.2 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  37.75 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  37.55 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.11 
 
 		 296 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  36.04 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  33.79 
 
 		 299 aa  112  6e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  37.89 
 
 		 309 aa  110  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  31.85 
 
 		 313 aa  104  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  34.63 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  34.63 
 
 		 249 aa  104  2e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 		 313 aa  102  6e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.52 
 
 		 311 aa  91.3  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  31.98 
 
 		 302 aa  89.7  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  31.08 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  34.83 
 
 		 312 aa  85.9  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  30.88 
 
 		 288 aa  85.5  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  33.5 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39760  hypothetical protein  34.83 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.112836  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  32.24 
 
 		 309 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 318 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  31.02 
 
 		 309 aa  46.2  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1182  hypothetical protein  30 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.983056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1335  transporter  30 
 
 		 356 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.324235  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0969  hypothetical protein  31.65 
 
 		 402 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1174  hypothetical protein  30.8 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1021  hypothetical protein  29.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0844  hypothetical protein  29.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.338271  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3201  RarD protein, DMT superfamily transporter  27.48 
 
 		 333 aa  44.3  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.786904  normal  0.510387 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0304  hypothetical protein  29.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.457394  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1932  hypothetical protein  29.58 
 
 		 356 aa  44.3  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248782  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05410  predicted permease, DMT superfamily  25.89 
 
 		 312 aa  43.5  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.41466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>