58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1890 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1890  hypothetical protein  100 
 
 		 341 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.702262  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1395  hypothetical protein  57.84 
 
 		 306 aa  309  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1332  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.58 
 
 		 306 aa  296  3e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.748197  normal  0.92031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  59.57 
 
 		 306 aa  289  6e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.169133 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1673  DMT family permease  52.19 
 
 		 331 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0223654 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1347  hypothetical protein  49.15 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.337035  normal  0.221181 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2047  hypothetical protein  46.98 
 
 		 313 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2027  hypothetical protein  46.64 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0596377  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6050  hypothetical protein  46.64 
 
 		 338 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2060  hypothetical protein  47.19 
 
 		 313 aa  258  1e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1929  hypothetical protein  46.86 
 
 		 313 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.208356 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5337  hypothetical protein  45.64 
 
 		 313 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.149517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1249  hypothetical protein  47.87 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.51 
 
 		 331 aa  246  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0969353  hitchhiker  0.0000570043 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2503  integral membrane protein  47.75 
 
 		 315 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.34695  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2593  hypothetical protein  46.89 
 
 		 825 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.872158  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2018  hypothetical protein  47.3 
 
 		 329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2447  integral membrane protein  48.1 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.279852  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2066  hypothetical protein  47.85 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.954235  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1338  hypothetical protein  47.4 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1564  hypothetical protein  47.4 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0714867  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3245  hypothetical protein  47.4 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.458807  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1849  hypothetical protein  38.71 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000666124  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1222  integral membrane protein, DUF6  38.54 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3564  putative transmembrane protein  41.25 
 
 		 304 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.227848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0227  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.59 
 
 		 296 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.4176  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0922  hypothetical protein  37.5 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0309  hypothetical protein  37.24 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0191  hypothetical protein  35.46 
 
 		 309 aa  119  7e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0174  hypothetical protein  35.86 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.542868  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0192  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.86 
 
 		 313 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0129  hypothetical protein  37.65 
 
 		 302 aa  96.7  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1824  hypothetical protein  33.07 
 
 		 249 aa  96.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.43404  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1499  protein of unknown function DUF6  33.07 
 
 		 249 aa  96.7  5e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0456527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0486  hypothetical protein  34.87 
 
 		 312 aa  95.5  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0251  hypothetical protein  36.36 
 
 		 264 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1889  putative transmembrane protein  29.03 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1538  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.48 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1801  hypothetical protein  26.6 
 
 		 284 aa  66.6  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1538  hypothetical protein  25.63 
 
 		 292 aa  53.1  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.746506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.64 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  27.05 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  26.3 
 
 		 301 aa  51.6  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  25.95 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.532448 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1502  hypothetical protein  26.03 
 
 		 292 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.207874  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1508  hypothetical protein  26.03 
 
 		 219 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.96 
 
 		 293 aa  47.4  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2849  hypothetical protein  30.12 
 
 		 286 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  25.61 
 
 		 304 aa  47  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1107  hypothetical protein  28.04 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.9 
 
 		 313 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.58 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1024  ribosomal protein S6  25.23 
 
 		 293 aa  42.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>