180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0919 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  604  9.999999999999999e-173  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  35.84 
 
 
304 aa  161  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  34.38 
 
 
297 aa  159  8e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  33.9 
 
 
299 aa  155  7e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  33.77 
 
 
309 aa  155  8e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  27.97 
 
 
306 aa  149  8e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  28.14 
 
 
296 aa  138  1e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  29.28 
 
 
322 aa  136  5e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.69 
 
 
313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  29.28 
 
 
322 aa  132  9e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 
303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  29.61 
 
 
321 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.04 
 
 
315 aa  127  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.04 
 
 
315 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.04 
 
 
315 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.04 
 
 
315 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.04 
 
 
315 aa  125  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  27.4 
 
 
295 aa  125  9e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  28.32 
 
 
297 aa  124  2e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  30.82 
 
 
300 aa  124  2e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  30.17 
 
 
301 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 
309 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.15 
 
 
307 aa  121  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  30.13 
 
 
322 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.81 
 
 
299 aa  120  3e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.81 
 
 
307 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  28.47 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.47 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  28.47 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.14 
 
 
307 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.47 
 
 
307 aa  119  9e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  28.14 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  28.62 
 
 
320 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  28.62 
 
 
320 aa  117  3e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 
314 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  28.48 
 
 
321 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.23 
 
 
530 aa  115  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  28.95 
 
 
322 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  28.95 
 
 
322 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  28.95 
 
 
322 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  28.95 
 
 
322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  27.56 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  24.91 
 
 
299 aa  110  2.0000000000000002e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  25.51 
 
 
308 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.78 
 
 
308 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  27.63 
 
 
319 aa  108  9.000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  26.1 
 
 
308 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  25.91 
 
 
308 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  26.69 
 
 
308 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  26.69 
 
 
308 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  26.69 
 
 
308 aa  108  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  29.06 
 
 
304 aa  107  2e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 
520 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  28.01 
 
 
304 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  26.42 
 
 
308 aa  106  6e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  25.5 
 
 
300 aa  105  7e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  25.76 
 
 
310 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  25.42 
 
 
296 aa  101  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  25.33 
 
 
308 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.18 
 
 
321 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.16 
 
 
331 aa  96.7  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
293 aa  94.7  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  20.94 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  24.57 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  24.07 
 
 
358 aa  90.1  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  24.41 
 
 
290 aa  89.4  7e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  27.27 
 
 
315 aa  86.7  5e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1464  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.38 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  23.91 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1563  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.59 
 
 
305 aa  55.8  0.0000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.324691  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.67 
 
 
309 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0320  hypothetical protein  21.13 
 
 
310 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0395  hypothetical protein  24.39 
 
 
291 aa  54.3  0.000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460041  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  21.86 
 
 
317 aa  53.5  0.000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  33.07 
 
 
320 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0752  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.726444  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0770  hypothetical protein  29.82 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25.67 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  25.13 
 
 
357 aa  51.2  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
341 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1849  hypothetical protein  28.57 
 
 
319 aa  50.4  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.5 
 
 
299 aa  50.1  0.00005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3395  hypothetical protein  22.59 
 
 
305 aa  50.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.92 
 
 
304 aa  49.3  0.00008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  23.27 
 
 
294 aa  48.9  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  26.36 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  26.52 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1118  hypothetical protein  27.83 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541387  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  26.52 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1916  hypothetical protein  23.79 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.594708  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1135  hypothetical protein  27.83 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0717  transporter DMT superfamily protein  27.96 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.424655  normal  0.726711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  26.52 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  23.21 
 
 
303 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0739  integral membrane protein  19.67 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0224771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  22.77 
 
 
303 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  22.77 
 
 
303 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1147  hypothetical protein  27.83 
 
 
359 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.402161  normal  0.266634 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  23.32 
 
 
303 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>