234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_7043 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7043  RarD protein, DMT superfamily transporter  100 
 
 		 298 aa  577  1e-164  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.497948  normal  0.0116084 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0025  RarD protein  85.57 
 
 		 298 aa  474  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4122  transporter DMT superfamily protein  73.74 
 
 		 296 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0111  RarD protein  72.16 
 
 		 299 aa  379  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4725  transporter DMT superfamily protein  70.79 
 
 		 299 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5313  rarD protein  70.45 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.211917  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5547  transporter DMT superfamily protein  70.45 
 
 		 299 aa  371  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.384238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5418  transporter DMT superfamily protein  71.13 
 
 		 299 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3259  transporter DMT superfamily protein  70.1 
 
 		 299 aa  352  5e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0786612 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4871  transporter DMT superfamily protein  70.1 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1278  rarD protein  70.03 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2921  RarD protein  70.03 
 
 		 297 aa  322  6e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.037743  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2239  rarD protein  68.29 
 
 		 297 aa  320  3e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1956  rarD protein  69.69 
 
 		 297 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.435358  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1260  rarD protein  69.69 
 
 		 297 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2234  RarD protein  69.69 
 
 		 297 aa  319  5e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0973  rarD protein  69.34 
 
 		 297 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3046  RarD protein  69.34 
 
 		 297 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1302  transporter DMT superfamily protein  54.36 
 
 		 297 aa  276  2e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.836717  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3436  RarD protein, DMT superfamily transporter  49.13 
 
 		 295 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.509712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2327  transporter DMT superfamily protein  49.13 
 
 		 295 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2437  transporter DMT superfamily protein  49.83 
 
 		 295 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2500  transporter DMT superfamily protein  50.18 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00712457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3162  transporter DMT superfamily protein  47.75 
 
 		 294 aa  225  7e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1653  hypothetical protein  49.83 
 
 		 311 aa  223  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19160  hypothetical protein  49.13 
 
 		 299 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.552283 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3361  RarD protein  46.13 
 
 		 294 aa  217  2e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0796601  normal  0.898727 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2916  RarD protein  45.99 
 
 		 293 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.861039  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3591  rarD protein  45.77 
 
 		 307 aa  202  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1360  RarD protein, DMT superfamily transporter  48.8 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0549521  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2500  transporter DMT superfamily protein  48.45 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  0.016455 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0947  transporter DMT superfamily protein  37.11 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0982  transporter DMT superfamily protein  37.11 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1849  transporter DMT superfamily protein  34.8 
 
 		 330 aa  175  9e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000022678 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1723  rarD protein  39.09 
 
 		 356 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.404594  normal  0.849801 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0357  rarD protein  34.23 
 
 		 336 aa  169  7e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0687634 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2440  rarD protein  37.45 
 
 		 289 aa  158  9e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12249  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3832  transporter DMT superfamily protein  32.76 
 
 		 295 aa  135  8e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0151  RarD protein  28.22 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0389  rarD protein  30.63 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000602328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5181  RarD protein  30.95 
 
 		 295 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000181331  normal  0.141075 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4554  transporter DMT superfamily protein  31.79 
 
 		 296 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00538746 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1944  RarD protein  27.93 
 
 		 294 aa  120  1.9999999999999998e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000444417  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0407  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.63 
 
 		 294 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0219498  hitchhiker  0.000000000129202 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03698  predicted chloramphenical resistance permease  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4160  RarD protein, DMT superfamily transporter  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4189  transporter DMT superfamily protein  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0936  rarD protein  32.46 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03647  hypothetical protein  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4340  RarD protein  28.38 
 
 		 295 aa  119  6e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4186  RarD protein  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0171366 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4043  RarD protein  28.38 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4001  transporter DMT superfamily protein  30.77 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.948028  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0215  RarD protein  30.77 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0552  hypothetical protein  30.77 
 
 		 296 aa  119  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5260  RarD protein  28.38 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.946168  normal  0.789863 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3476  transporter DMT superfamily protein  29.31 
 
 		 295 aa  119  9e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0393  transporter DMT superfamily protein  30.63 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.725553  hitchhiker  0.00047979 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4285  RarD protein  28.38 
 
 		 301 aa  118  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0382  transporter DMT superfamily protein  30.63 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000260751  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0381  transporter DMT superfamily protein  30.63 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.628097  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4163  RarD protein  30.27 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4184  RarD protein  29.87 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0364  transporter DMT superfamily protein  30.88 
 
 		 294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0167  transporter DMT superfamily protein  27.52 
 
 		 304 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.800787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3574  rarD protein  26.73 
 
 		 313 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3592  transporter DMT superfamily protein  30.63 
 
 		 294 aa  117  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.228436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3765  transporter DMT superfamily protein  30.42 
 
 		 295 aa  117  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0588  hypothetical protein  32.01 
 
 		 298 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0009394  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2575  rarD protein  30.56 
 
 		 302 aa  117  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.859473  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4282  hypothetical protein  29.87 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.816229 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06320  hypothetical protein  31.68 
 
 		 298 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257668  normal  0.652211 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3584  rarD protein  26.73 
 
 		 313 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.884243  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4235  RarD protein  29.87 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0467  transporter DMT superfamily protein  30.28 
 
 		 294 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.323574  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4342  RarD protein  29.87 
 
 		 295 aa  116  3.9999999999999997e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0330  rarD protein  28.92 
 
 		 300 aa  115  6e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2776  transporter DMT superfamily protein  24.66 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2719  transporter DMT superfamily protein  24.66 
 
 		 302 aa  115  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2331  rarD protein  25.59 
 
 		 301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3967  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.03 
 
 		 309 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.807001  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4243  rarD protein  30.42 
 
 		 294 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1650  rarD protein  26.4 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.754909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0667  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.59 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000233047  hitchhiker  0.00000296435 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3353  rarD protein  26.91 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.412924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3267  chloramphenicol-sensitive rarD protein  26.91 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.905769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3567  rarD protein  26.91 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.619892 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3614  rarD protein  26.91 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472217  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3667  rarD protein  26.4 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3824  transporter DMT superfamily protein  28.72 
 
 		 302 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0223  chloramphenicol-sensitive protein RarD  30.66 
 
 		 305 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.198756  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4157  RarD protein, DMT superfamily transporter  29.7 
 
 		 309 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.149197  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0358  RarD protein, DMT superfamily transporter  30.24 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.0000108784  normal  0.875961 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3424  transporter DMT superfamily protein  30.61 
 
 		 308 aa  113  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110688  normal  0.0105884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0190  transporter DMT superfamily protein  31.44 
 
 		 295 aa  113  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.7183 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2234  transporter DMT superfamily protein  25.5 
 
 		 315 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.201447  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3977  transporter DMT superfamily protein  28.43 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216532  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0332  rarD protein  31.54 
 
 		 293 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.100395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3317  chloramphenicol-sensitive RarD protein  26.58 
 
 		 313 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00345  permease  29.49 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>