98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7770 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7770  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
317 aa  606  9.999999999999999e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1219  hypothetical protein  48.95 
 
 
306 aa  208  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.465362  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1136  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.51 
 
 
286 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.762369  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0721  hypothetical protein  45.14 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.117715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0667  hypothetical protein  45.8 
 
 
319 aa  156  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.522504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0010  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.89 
 
 
312 aa  144  1e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000132585 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  36.67 
 
 
305 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2249  hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00767545  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2413  hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  136  5e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2169  permease; drug/metabolite exporter family protein  34.04 
 
 
294 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.101612  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2208  permease; drug/metabolite exporter family protein  34.04 
 
 
294 aa  135  8e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749629  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2431  hypothetical protein  34.04 
 
 
294 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.295627 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0009  hypothetical protein  39.58 
 
 
304 aa  132  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2952  hypothetical protein  32.98 
 
 
295 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0338649  hitchhiker  0.0000000562298 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3390  hypothetical protein  35.97 
 
 
302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2512  hypothetical protein  33.79 
 
 
295 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0135792  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2268  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.07 
 
 
302 aa  126  5e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  32.74 
 
 
296 aa  125  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2379  hypothetical protein  34.53 
 
 
295 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.557677  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2848  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
300 aa  124  3e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2925  hypothetical protein  32.99 
 
 
308 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0149695  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1947  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.16 
 
 
298 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1520  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.62 
 
 
295 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  decreased coverage  0.00453579 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.44 
 
 
302 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14500  membrane protein  30.63 
 
 
286 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00083685  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  32.99 
 
 
310 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0564  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.23 
 
 
305 aa  108  9.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0748  hypothetical protein  34.75 
 
 
288 aa  106  4e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2028  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.82 
 
 
316 aa  105  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1219  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.27 
 
 
288 aa  102  7e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.95 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2001  hypothetical protein  32.77 
 
 
283 aa  96.3  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0219  hypothetical protein  26.52 
 
 
300 aa  95.5  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3157  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
307 aa  94.7  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3817  hypothetical protein  27.21 
 
 
296 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000393324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2761  hypothetical protein  32.48 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112871  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0152  hypothetical protein  26.16 
 
 
297 aa  91.3  2e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0587  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.97 
 
 
300 aa  89.4  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.770016  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1257  hypothetical protein  38.91 
 
 
277 aa  88.2  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_160  hypothetical protein  26.22 
 
 
297 aa  87.4  3e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3110  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.21 
 
 
293 aa  86.3  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.918526  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2109  hypothetical protein  29.33 
 
 
295 aa  86.3  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.68 
 
 
296 aa  85.5  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0896  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.96 
 
 
295 aa  84.7  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.841785  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.05 
 
 
307 aa  84  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00280057  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2018  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.618176 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1991  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
300 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0063  hypothetical protein  30.58 
 
 
285 aa  81.3  0.00000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0947  hypothetical protein  27.3 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0647219  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 
304 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.484087 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3455  hypothetical protein  28.52 
 
 
300 aa  76.3  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1388  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00161471  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1123  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 
303 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0751  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
284 aa  70.5  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1243  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.142869  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1130  membrane protein; drug/metabolite exporter family protein  26.09 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0451138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1149  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4059  hypothetical protein  26.64 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0153728  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1311  hypothetical protein  26.09 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000102965 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1137  hypothetical protein  25.46 
 
 
303 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0899192  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1285  hypothetical protein  26.38 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.150525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0861  hypothetical protein  22.01 
 
 
294 aa  68.6  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1350  hypothetical protein  27.73 
 
 
309 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287867  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2511  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.32 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000710736  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2519  hypothetical protein  33.09 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.561835 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0089  hypothetical protein  30.38 
 
 
285 aa  60.5  0.00000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.893408  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1137  hypothetical protein  27.59 
 
 
285 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.893174  hitchhiker  0.00000000116999 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.64 
 
 
305 aa  59.7  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00557636 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46762  predicted protein  25.44 
 
 
461 aa  57  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.013384  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.79 
 
 
284 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0312  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
301 aa  54.3  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.66 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1705  hypothetical protein  33.79 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000102674 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2973  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.62 
 
 
325 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  27.73 
 
 
294 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0997  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
315 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  0.602087 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0968  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.38 
 
 
314 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1399  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.93 
 
 
300 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.420526  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  25.18 
 
 
296 aa  49.3  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  25.52 
 
 
292 aa  49.3  0.00008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2413  hypothetical protein  25.35 
 
 
281 aa  49.3  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.163379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  33.1 
 
 
293 aa  48.5  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0097  hypothetical protein  27.67 
 
 
286 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  26.63 
 
 
299 aa  47.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0610  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.62 
 
 
313 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.371435  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  27.85 
 
 
294 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1038  hypothetical protein  28.48 
 
 
273 aa  45.8  0.0008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000348344  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  27.85 
 
 
294 aa  45.8  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4912  membrane protein  27.17 
 
 
298 aa  45.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2973  hypothetical protein  24.45 
 
 
325 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3886  hypothetical protein  24.3 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.765611  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  23.4 
 
 
296 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30790  hypothetical protein  30.56 
 
 
299 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.316745  hitchhiker  0.000000000195244 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  24.73 
 
 
296 aa  43.5  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2194  hypothetical protein  30.77 
 
 
305 aa  43.9  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00374881 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2300  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.84 
 
 
298 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2900  hypothetical protein  33.11 
 
 
308 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.149951  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2040  hypothetical protein  30.95 
 
 
308 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.136673  normal  0.653396 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>