107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2933 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  100 
 
 
301 aa  589  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  42.2 
 
 
301 aa  207  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.54 
 
 
300 aa  205  7e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  41.22 
 
 
301 aa  202  6e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  37.15 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  38.57 
 
 
304 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  39.86 
 
 
300 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 
299 aa  196  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.53 
 
 
298 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  39.86 
 
 
298 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  39.08 
 
 
298 aa  191  9e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.69 
 
 
300 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  38.73 
 
 
300 aa  188  8e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.92 
 
 
303 aa  186  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  38.43 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  38.08 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  40.14 
 
 
300 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  42.7 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  41.26 
 
 
308 aa  184  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  33.45 
 
 
309 aa  182  7e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.01 
 
 
292 aa  179  5.999999999999999e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  39.72 
 
 
298 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  39.72 
 
 
298 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  39.65 
 
 
296 aa  176  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  35.12 
 
 
303 aa  176  5e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  39.45 
 
 
296 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  39.1 
 
 
395 aa  176  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  42.96 
 
 
300 aa  175  8e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  39.1 
 
 
296 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  35.12 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  35.12 
 
 
303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  38.75 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  38.75 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  38.75 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  38.75 
 
 
296 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  40.34 
 
 
299 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.36 
 
 
303 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  38.54 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  40.14 
 
 
296 aa  170  3e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  40.98 
 
 
296 aa  169  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  40.53 
 
 
296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  40.53 
 
 
296 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  34.17 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.75 
 
 
299 aa  159  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  35.82 
 
 
307 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  31.91 
 
 
293 aa  147  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  34.62 
 
 
308 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  30.8 
 
 
300 aa  135  9.999999999999999e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  34.33 
 
 
307 aa  130  2.0000000000000002e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  32.16 
 
 
298 aa  130  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  35.98 
 
 
284 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  30.17 
 
 
319 aa  116  6e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  25.81 
 
 
301 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  27.42 
 
 
298 aa  73.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  29.52 
 
 
294 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0530  hypothetical protein  30 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.584657  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  23.62 
 
 
317 aa  55.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1972  hypothetical protein  24.04 
 
 
312 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1859  integral membrane protein  24.04 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0728  hypothetical protein  33.52 
 
 
306 aa  53.5  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  29 
 
 
296 aa  52  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  52.4  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  23.96 
 
 
304 aa  52  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  51.6  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.42 
 
 
308 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  25.82 
 
 
315 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.23 
 
 
317 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  20.7 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  20.7 
 
 
304 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0286  hypothetical protein  27.89 
 
 
293 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00960763  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  28.16 
 
 
296 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  25.34 
 
 
312 aa  48.9  0.00009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0178  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 
315 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  24.66 
 
 
312 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  23.35 
 
 
318 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  24.41 
 
 
295 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  24.58 
 
 
294 aa  47.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 
305 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1550  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 
315 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.213106  normal  0.0477313 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  27.14 
 
 
292 aa  47  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  26.59 
 
 
300 aa  47  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  26.49 
 
 
326 aa  45.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.99 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  25.55 
 
 
297 aa  45.4  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1833  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.89 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.40235  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  26.53 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.83 
 
 
306 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  22.6 
 
 
303 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  27.3 
 
 
307 aa  45.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.74 
 
 
299 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.58 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2227  hypothetical protein  25.62 
 
 
296 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.157307  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3677  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
285 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.24 
 
 
321 aa  44.3  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0926  hypothetical protein  25 
 
 
305 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.8 
 
 
292 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2047  hypothetical protein  20.22 
 
 
314 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>