294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1208 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  587  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  97.99 
 
 
300 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  79.24 
 
 
301 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  74.48 
 
 
300 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  73.33 
 
 
300 aa  417  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  74.48 
 
 
300 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  75 
 
 
300 aa  397  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  74.5 
 
 
298 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  77.24 
 
 
300 aa  395  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  74 
 
 
300 aa  388  1e-107  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  56.84 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  56.49 
 
 
395 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  58.76 
 
 
308 aa  305  8.000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  56.49 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  56.49 
 
 
296 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  56.14 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  56.14 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  56.14 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  56.14 
 
 
316 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  56.14 
 
 
296 aa  296  2e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  56.14 
 
 
298 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  56.14 
 
 
298 aa  290  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.08 
 
 
298 aa  288  8e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  53.98 
 
 
299 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.17 
 
 
298 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  56.49 
 
 
296 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  56.49 
 
 
296 aa  280  2e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  56.49 
 
 
296 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  56.49 
 
 
296 aa  279  3e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  52.23 
 
 
299 aa  275  8e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  55.43 
 
 
299 aa  275  9e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.68 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  49.48 
 
 
298 aa  273  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  51.9 
 
 
301 aa  267  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.85 
 
 
300 aa  261  8.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.83 
 
 
303 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.85 
 
 
292 aa  238  1e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  45.3 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  46.02 
 
 
309 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  44.48 
 
 
303 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  44.48 
 
 
303 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  44.15 
 
 
303 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  45.99 
 
 
304 aa  232  7.000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.15 
 
 
303 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  41.78 
 
 
301 aa  219  5e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  41.07 
 
 
293 aa  200  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  42.36 
 
 
307 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  38.78 
 
 
308 aa  187  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  44.53 
 
 
284 aa  175  9e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 
295 aa  167  2e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  35.31 
 
 
300 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  34.62 
 
 
298 aa  148  9e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  34.93 
 
 
319 aa  138  1e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  36.43 
 
 
307 aa  136  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  31.5 
 
 
301 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.72 
 
 
308 aa  86.7  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  29.34 
 
 
318 aa  82.8  0.000000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  29.03 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.47 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  26.52 
 
 
317 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  31.44 
 
 
300 aa  70.5  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  27.78 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  26.21 
 
 
298 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.75 
 
 
305 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 
304 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  27.88 
 
 
299 aa  65.1  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
315 aa  65.5  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.79 
 
 
296 aa  64.7  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  25.25 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1024  hypothetical protein  30.45 
 
 
330 aa  64.7  0.000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  30.34 
 
 
298 aa  63.9  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  26 
 
 
305 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  28.36 
 
 
307 aa  63.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  28.86 
 
 
292 aa  62.8  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  25.7 
 
 
298 aa  62.4  0.000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2471  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 
305 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  26.3 
 
 
305 aa  61.6  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.78 
 
 
315 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.75 
 
 
305 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  26.71 
 
 
294 aa  60.8  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  25.71 
 
 
310 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  25.35 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  25.35 
 
 
308 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  19.8 
 
 
312 aa  60.1  0.00000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  27.08 
 
 
310 aa  60.1  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  59.7  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.82 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2744  transporter, EamA family  25.82 
 
 
305 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55496e-17 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  25.25 
 
 
313 aa  59.3  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 
296 aa  59.3  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  33.81 
 
 
296 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
309 aa  58.9  0.00000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  25.09 
 
 
305 aa  58.9  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2018  hypothetical protein  23.86 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  24.1 
 
 
308 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2072  hypothetical protein  23.86 
 
 
304 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
310 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  28.18 
 
 
311 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
317 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>