239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0998 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  597  1e-170  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  43.06 
 
 		 309 aa  239  5e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  43.86 
 
 		 293 aa  225  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  50.19 
 
 		 284 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.04 
 
 		 298 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  45.49 
 
 		 300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.3 
 
 		 298 aa  212  7.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  41.32 
 
 		 298 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.18 
 
 		 299 aa  209  5e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.47 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  43.75 
 
 		 301 aa  204  2e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  37.15 
 
 		 300 aa  203  4e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  43.86 
 
 		 395 aa  202  5e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  42.66 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  43.86 
 
 		 296 aa  202  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  43.86 
 
 		 296 aa  202  7e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  43.16 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  43.51 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  42.71 
 
 		 414 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  44.64 
 
 		 301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  43.51 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  43.51 
 
 		 296 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  43.51 
 
 		 316 aa  200  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  42.91 
 
 		 298 aa  198  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  42.21 
 
 		 300 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  43.36 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  42.86 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.59 
 
 		 299 aa  192  8e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  41.87 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  42.61 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  43.4 
 
 		 296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  42.64 
 
 		 296 aa  189  5e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  43.66 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  43.66 
 
 		 296 aa  189  7e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  45.14 
 
 		 300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  41.75 
 
 		 308 aa  184  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.41 
 
 		 292 aa  182  6e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  39.02 
 
 		 304 aa  175  7e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  43.54 
 
 		 300 aa  175  9e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  42.31 
 
 		 300 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.61 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  38.1 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  36.43 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  36.43 
 
 		 303 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  36.43 
 
 		 303 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  35.37 
 
 		 301 aa  165  8e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.08 
 
 		 303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  41.78 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.27 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  36.46 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  32.29 
 
 		 309 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.08 
 
 		 295 aa  149  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  35.92 
 
 		 319 aa  142  7e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  31.37 
 
 		 301 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.46 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  29.32 
 
 		 318 aa  82  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 		 317 aa  80.1  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  25.48 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.63 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  32.75 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  29.52 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.68 
 
 		 340 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  31.68 
 
 		 299 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  29.92 
 
 		 311 aa  72.8  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.43 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.97 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.11 
 
 		 306 aa  67.8  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  31.37 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  31.18 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  31.98 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  29.85 
 
 		 303 aa  64.3  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.14 
 
 		 315 aa  62.8  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  25.84 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  25.84 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  29.12 
 
 		 325 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.89 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  27.78 
 
 		 306 aa  60.1  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 348 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  27.76 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  27.63 
 
 		 310 aa  60.1  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.34 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  29.17 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2179  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  27.42 
 
 		 293 aa  57.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  29.28 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.96 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  27.5 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.03 
 
 		 315 aa  57  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.51 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  29.28 
 
 		 306 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  32.48 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  29.17 
 
 		 306 aa  55.8  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  24.33 
 
 		 321 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>