248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1880 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 295 aa  567  1e-161  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  50 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  45.1 
 
 		 292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41 
 
 		 300 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  40.62 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  42.65 
 
 		 301 aa  182  8.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  43.77 
 
 		 296 aa  181  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  43.82 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  43.15 
 
 		 301 aa  180  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  43.82 
 
 		 298 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  42.35 
 
 		 296 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  42.35 
 
 		 296 aa  180  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  42.35 
 
 		 395 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  41.3 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  41.99 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  41.99 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  41.99 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.67 
 
 		 298 aa  178  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  41.99 
 
 		 316 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  42.7 
 
 		 414 aa  177  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.93 
 
 		 298 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.91 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.14 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  39.86 
 
 		 300 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  44.17 
 
 		 296 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.53 
 
 		 303 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  44.17 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  44.17 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  39.44 
 
 		 300 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  40.93 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  44.17 
 
 		 296 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  37.67 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  38.11 
 
 		 303 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  38.11 
 
 		 303 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.76 
 
 		 303 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  37.76 
 
 		 303 aa  159  4e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  38.41 
 
 		 300 aa  159  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.99 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  38.03 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  35.15 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  38.78 
 
 		 308 aa  157  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  38.87 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  39.66 
 
 		 300 aa  149  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  38.87 
 
 		 300 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  37.68 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  40.93 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  40.85 
 
 		 300 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  34.4 
 
 		 293 aa  136  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  33.11 
 
 		 300 aa  136  4e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  30.95 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  36.36 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  37.93 
 
 		 284 aa  125  9e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  35.53 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  30.24 
 
 		 319 aa  94.7  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  26.21 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2233  hypothetical protein  31.14 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456309  hitchhiker  0.000692122 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.92 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  28.37 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  30.42 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  30.18 
 
 		 315 aa  63.9  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0721  hypothetical protein  28.36 
 
 		 294 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0361886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0694  hypothetical protein  27.43 
 
 		 313 aa  63.9  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  26.64 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  28.07 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  27.53 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  27.53 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  27.6 
 
 		 298 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  28.23 
 
 		 306 aa  60.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  28.12 
 
 		 306 aa  59.7  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  29.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.5 
 
 		 305 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  29.62 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2764  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.65 
 
 		 305 aa  59.3  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.72 
 
 		 315 aa  59.3  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  30.15 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.13 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  30.23 
 
 		 292 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  29.73 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.87 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.22 
 
 		 319 aa  58.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  29.66 
 
 		 303 aa  57.4  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0905  putative transporter  27.54 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0908  putative transporter  27.54 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  27.6 
 
 		 296 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  25.62 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  30.38 
 
 		 306 aa  57  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3338  hypothetical protein  24.82 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.252912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4679  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  24.81 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05180  hypothetical protein  27.52 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  28.77 
 
 		 316 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.15 
 
 		 318 aa  55.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  26.72 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>