251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1042 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1042  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  590  1e-168  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.214105  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1214  membrane protein  96 
 
 		 300 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.201736  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4463  hypothetical protein  80.13 
 
 		 300 aa  455  1e-127  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3232  hypothetical protein  77.82 
 
 		 301 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.274981  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4604  hypothetical protein  81.31 
 
 		 300 aa  434  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0860  hypothetical protein  81.38 
 
 		 298 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4586  hypothetical protein  82.93 
 
 		 300 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.560139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0934  hypothetical protein  78.67 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1208  hypothetical protein  76.57 
 
 		 300 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13490  hypothetical protein  75.43 
 
 		 300 aa  369  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  56.85 
 
 		 296 aa  318  7e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  54.67 
 
 		 414 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  54.33 
 
 		 395 aa  308  8e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  54.33 
 
 		 296 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  54.33 
 
 		 296 aa  307  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  53.98 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  53.98 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  53.98 
 
 		 296 aa  305  4.0000000000000004e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  53.98 
 
 		 316 aa  305  7e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  56.06 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  56.06 
 
 		 298 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  57.09 
 
 		 308 aa  297  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  52.98 
 
 		 299 aa  291  8e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  56.06 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  55.36 
 
 		 296 aa  288  6e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  56.06 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  56.06 
 
 		 296 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.27 
 
 		 299 aa  287  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2509  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.34 
 
 		 298 aa  285  5.999999999999999e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2418  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.19 
 
 		 298 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0488921  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2933  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.9 
 
 		 299 aa  281  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1731  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.56 
 
 		 300 aa  278  9e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.774679  normal  0.0492029 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.38 
 
 		 300 aa  275  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1979  hypothetical protein  49.83 
 
 		 298 aa  271  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.959663 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2336  hypothetical protein  51.74 
 
 		 301 aa  269  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000121234  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6512  protein of unknown function DUF6 transmembrane  53.21 
 
 		 292 aa  256  4e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.955687  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6618  protein of unknown function DUF6 transmembrane  50.35 
 
 		 303 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.19492 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0535  hypothetical protein  43.75 
 
 		 304 aa  229  6e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  44.83 
 
 		 309 aa  223  2e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4613  membrane protein  44.76 
 
 		 309 aa  222  4.9999999999999996e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  43.4 
 
 		 303 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  43.4 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.06 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  43.06 
 
 		 303 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0998  hypothetical protein  44.25 
 
 		 307 aa  213  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0396648  hitchhiker  0.00267069 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2933  hypothetical protein  39.5 
 
 		 301 aa  211  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000228681  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2211  hypothetical protein  40.97 
 
 		 293 aa  199  6e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4205  hypothetical protein  38.75 
 
 		 308 aa  195  6e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.43183 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3370  hypothetical protein  42.11 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1880  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.73 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.010243 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4261  hypothetical protein  36.21 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04029  membrane protein  32.4 
 
 		 300 aa  150  3e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0497  hypothetical protein  31.86 
 
 		 319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.855711 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3268  hypothetical protein  32.06 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0089  membrane protein  29.69 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  26.77 
 
 		 318 aa  75.1  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  25.95 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  25.36 
 
 		 294 aa  69.7  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  28.27 
 
 		 299 aa  66.6  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.63 
 
 		 298 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 		 317 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2410  hypothetical protein  25.61 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0228  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.11 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2020  hypothetical protein  23.31 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.252549 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0216  hypothetical protein  31.87 
 
 		 296 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.030228  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1111  hypothetical protein  27.56 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.901325  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 313 aa  60.5  0.00000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2030  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 340 aa  60.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  26.64 
 
 		 311 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5539  hypothetical protein  26.64 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  22.9 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  28.79 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  26.98 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.08 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.69 
 
 		 321 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 		 306 aa  58.2  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  25.12 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2587  membrane protein  24.73 
 
 		 298 aa  56.6  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  25.18 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.82 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 295 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2768  EamA family protein  25.42 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000452563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 		 310 aa  55.8  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0065  hypothetical protein  25.17 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.207446  normal  0.363936 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2748  transporter, EamA family  24.05 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4618  hypothetical protein  27.61 
 
 		 286 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2505  drug/metabolite exporter family protein  25.09 
 
 		 305 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000162037  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  24.83 
 
 		 306 aa  54.7  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.74 
 
 		 304 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  29.52 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2544  transporter, EamA family  24.23 
 
 		 305 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000168841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.57 
 
 		 312 aa  53.9  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  24.57 
 
 		 308 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  24.91 
 
 		 308 aa  53.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>