196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1280 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  100 
 
 
313 aa  619  1e-176  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  94.25 
 
 
313 aa  566  1e-160  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  90.1 
 
 
313 aa  553  1e-156  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  86.26 
 
 
313 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  66.78 
 
 
316 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  66.12 
 
 
316 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  62.38 
 
 
317 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  59.42 
 
 
319 aa  350  2e-95  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  56.72 
 
 
322 aa  335  5.999999999999999e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  57.7 
 
 
313 aa  330  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  42.6 
 
 
364 aa  229  6e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.89 
 
 
349 aa  219  5e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  43.62 
 
 
336 aa  211  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.42 
 
 
340 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  43.42 
 
 
340 aa  193  3e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  44.27 
 
 
356 aa  192  6e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.75 
 
 
335 aa  182  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  40.2 
 
 
300 aa  175  7e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  26.73 
 
 
324 aa  79  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  24.75 
 
 
303 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.46 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  24.42 
 
 
303 aa  73.6  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.31 
 
 
297 aa  73.6  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  27.24 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  27.55 
 
 
303 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  26.52 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  27.17 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  27.17 
 
 
303 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  25.76 
 
 
287 aa  69.3  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  26.79 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  26.79 
 
 
303 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  27.03 
 
 
301 aa  69.3  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  26.04 
 
 
303 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  26.79 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.95 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  26.42 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  26.74 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  26.74 
 
 
294 aa  67.4  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  26.42 
 
 
303 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  25.95 
 
 
306 aa  67  0.0000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.57 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  26.04 
 
 
303 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  26.41 
 
 
299 aa  65.5  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  23.72 
 
 
304 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  22.99 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  22.99 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  22.99 
 
 
304 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.34 
 
 
294 aa  62.8  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  24.63 
 
 
303 aa  62.8  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  24.82 
 
 
304 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  23.95 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  23.88 
 
 
307 aa  61.2  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  25.09 
 
 
290 aa  61.2  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1804  hypothetical protein  23 
 
 
296 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.363545  normal  0.129857 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4286  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.71 
 
 
303 aa  60.1  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.853408 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.74 
 
 
310 aa  59.7  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  25.45 
 
 
301 aa  59.7  0.00000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  29.37 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.4 
 
 
301 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  23.86 
 
 
312 aa  58.9  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4566  hypothetical protein  25.91 
 
 
395 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.912559  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  27.11 
 
 
306 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.9 
 
 
274 aa  58.5  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2560  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.3 
 
 
290 aa  57.4  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.711408  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.32 
 
 
314 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.26 
 
 
301 aa  56.6  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  23.38 
 
 
301 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.09 
 
 
321 aa  56.2  0.0000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.81 
 
 
306 aa  56.2  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  23.38 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  23.38 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  23.38 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  23.38 
 
 
301 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  23.74 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  25.08 
 
 
302 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  23.74 
 
 
301 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  23.38 
 
 
301 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0619  hypothetical protein  26.56 
 
 
346 aa  54.3  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.43 
 
 
302 aa  53.9  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  22.66 
 
 
301 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0523  hypothetical protein  23.13 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.599851  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  22.9 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  22.9 
 
 
306 aa  53.5  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.97 
 
 
283 aa  53.1  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  20.34 
 
 
293 aa  52.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  32.35 
 
 
304 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  22.22 
 
 
295 aa  52.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.28 
 
 
299 aa  52  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0519  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.71 
 
 
307 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  21.83 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4240  drug/metabolite exporter family protein  24.32 
 
 
299 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  21.83 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  22.59 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  22.59 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  22.59 
 
 
306 aa  51.2  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  24.83 
 
 
312 aa  51.6  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  24.41 
 
 
303 aa  51.6  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  21.83 
 
 
301 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.58 
 
 
283 aa  51.6  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  22.59 
 
 
306 aa  51.6  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>