More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5346 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_5346  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
335 aa  648    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2516  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.18 
 
 
340 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.19993  normal  0.244622 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3598  protein of unknown function DUF6 transmembrane  69.88 
 
 
340 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5105  protein of unknown function DUF6 transmembrane  64.78 
 
 
349 aa  391  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.910123  normal  0.400388 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2495  hypothetical protein  65.74 
 
 
336 aa  389  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.939833  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3529  hypothetical protein  65.88 
 
 
356 aa  364  1e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1917  permease of the drug/metabolite transporter  60.3 
 
 
364 aa  359  3e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1780  SMR family transporter-like protein  45.87 
 
 
322 aa  255  9e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_5328  DMT family transporter: drug/metabolite  53.02 
 
 
300 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.681519  normal  0.112664 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_16531  SMR family transporter  45.51 
 
 
316 aa  243  5e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.724697 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0798  SMR family transporter PecM  45.51 
 
 
316 aa  242  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12661  SMR family transporter PecM  44.09 
 
 
317 aa  223  3e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000571261 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0584  SMR family transporter PecM  43.91 
 
 
313 aa  215  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13801  SMR family transporter PecM  43.23 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13721  SMR family transporter  42.58 
 
 
313 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.125485  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06161  SMR family transporter  44.88 
 
 
319 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0364363 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1280  SMR family transporter PecM  42.43 
 
 
313 aa  205  7e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13511  SMR family transporter  41.83 
 
 
313 aa  205  9e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.468275  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1589  hypothetical protein  28.88 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.151328  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2354  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.71 
 
 
302 aa  93.2  6e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.165015  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  29.8 
 
 
297 aa  89  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.44 
 
 
312 aa  82.4  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.8 
 
 
312 aa  79.7  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3085  hypothetical protein  26.89 
 
 
319 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.229103  normal  0.567857 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2920  hypothetical protein  28.01 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  27.03 
 
 
311 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  25.49 
 
 
291 aa  75.1  0.000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0031  drug/metabolite transporter  28.09 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6822  normal  0.556158 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0154  drug/metabolite transporter  28.09 
 
 
294 aa  74.3  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.98831  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2295  hypothetical protein  30.77 
 
 
314 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1240  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
290 aa  72  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6477  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.12 
 
 
301 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.531293  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.38 
 
 
317 aa  70.1  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0642  RhaT family protein  30.67 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.479162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3369  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.49 
 
 
310 aa  69.3  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  28.52 
 
 
296 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0088  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.18 
 
 
290 aa  68.6  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.529373  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4164  hypothetical protein  24.57 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.49 
 
 
294 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.481619  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.27 
 
 
315 aa  67.4  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 
306 aa  67.8  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  27.21 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3501  hypothetical protein  26.69 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.172716 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3205  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.84 
 
 
306 aa  66.6  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2340  hypothetical protein  27.03 
 
 
303 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  65.9  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  65.1  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0744  hypothetical protein  25.16 
 
 
312 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.906344  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0169  hypothetical protein  26.49 
 
 
311 aa  64.3  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5985  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.48 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  26.46 
 
 
296 aa  64.3  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  26.44 
 
 
313 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  27.39 
 
 
312 aa  63.5  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  24.61 
 
 
306 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.74 
 
 
321 aa  63.2  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  28.73 
 
 
307 aa  63.2  0.000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1470  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.93 
 
 
313 aa  62.8  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  26.39 
 
 
287 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3106  hypothetical protein  27.85 
 
 
299 aa  61.6  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0777432  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  25.74 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.01 
 
 
283 aa  61.6  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1999  EamA family protein  26.14 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.099067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1777  EamA family protein  26.47 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00180942  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1756  drug/metabolite exporter family protein  26.47 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1734  drug/metabolite exporter family protein  26.47 
 
 
301 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1915  eama family protein  26.47 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0191779  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1951  transporter, EamA family  26.47 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000452263 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4020  DMT family permease  28.57 
 
 
330 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000861601  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1054  hypothetical protein  25 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.378299  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1919  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.47 
 
 
301 aa  60.8  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  26.04 
 
 
287 aa  60.5  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.4 
 
 
315 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7502  regulator protein pecM  24.76 
 
 
307 aa  60.1  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2255  hypothetical protein  26.75 
 
 
290 aa  60.1  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.116056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1789  hypothetical protein  26.25 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000223486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3424  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  26.47 
 
 
301 aa  60.1  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000803671 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0070  carboxylate/amino acid/amine transporter  29.9 
 
 
288 aa  60.1  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3337  hypothetical protein  26.11 
 
 
298 aa  59.7  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.491654 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0972  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.67 
 
 
306 aa  59.3  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.032769  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  27.92 
 
 
294 aa  59.3  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3261  hypothetical protein  25.89 
 
 
308 aa  59.3  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.923223 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1716  hypothetical protein  26.69 
 
 
292 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.889614  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2020  transporter, EamA family  26.32 
 
 
283 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000240822  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4940  hypothetical protein  27.74 
 
 
303 aa  58.2  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.361149  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  23.24 
 
 
274 aa  57.8  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5289  regulator protein PecM  26.64 
 
 
318 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.517421 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6431  hypothetical protein  24.52 
 
 
315 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.275967  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0318  hypothetical protein  27.03 
 
 
304 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.42 
 
 
314 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  25.34 
 
 
304 aa  57.4  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4047  hypothetical protein  25.57 
 
 
312 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3131  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 
295 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>