133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_0172 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012793  GWCH70_0172  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 
186 aa  371  1e-102  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  46.23 
 
 
300 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0684948  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2043  hypothetical protein  33.03 
 
 
304 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5404  putative transporter  33.33 
 
 
301 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.532448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03829  predicted permease  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4042  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3057  transporter, EamA family  30.95 
 
 
303 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03778  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4177  putative transporter  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4483  putative transporter  33.33 
 
 
301 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4072  hypothetical protein  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4391  putative transporter  33.33 
 
 
301 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.568191 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2848  EamA family protein  31.19 
 
 
303 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2780  drug/metabolite exporter family protein  31.19 
 
 
303 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3061  eama family protein  31.19 
 
 
303 aa  59.7  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2189  transporter, EamA family  30.28 
 
 
303 aa  58.9  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000931242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 
299 aa  58.9  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4430  putative transporter  33.33 
 
 
304 aa  58.2  0.00000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3073  transporter, EamA family  30.28 
 
 
303 aa  58.2  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  30.28 
 
 
303 aa  57.8  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2821  drug/metabolite exporter family protein  30.28 
 
 
303 aa  58.2  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2185  hypothetical protein  29.91 
 
 
291 aa  57.8  0.00000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3090  transporter, EamA family  30.28 
 
 
303 aa  57.8  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0880872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.37 
 
 
287 aa  57.8  0.00000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2686  transporter, EamA family  31.78 
 
 
304 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000188959 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  34.91 
 
 
291 aa  57.4  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  29.36 
 
 
287 aa  57  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2709  EamA family protein  33.33 
 
 
304 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00270641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2450  drug/metabolite exporter family protein  31.78 
 
 
303 aa  57  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000213459  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2739  permease, drug/metabolite transporter superfamily  30.84 
 
 
303 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000046973  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  30.83 
 
 
298 aa  55.8  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2840  hypothetical protein  29.36 
 
 
303 aa  56.2  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.269386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1615  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.14 
 
 
291 aa  55.5  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  32.38 
 
 
304 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2616  transporter, EamA family  29.92 
 
 
304 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000255461 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0367  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.64 
 
 
293 aa  55.5  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2356  hypothetical protein  30.1 
 
 
305 aa  55.1  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.469762  normal  0.368317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2420  drug/metabolite exporter family protein  30.48 
 
 
304 aa  54.7  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.220238  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  28.44 
 
 
287 aa  54.7  0.0000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  28.46 
 
 
312 aa  54.7  0.0000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2489  EamA family protein  30.48 
 
 
304 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.432631  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2672  eama family protein  30.48 
 
 
304 aa  54.7  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.43207  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  31.43 
 
 
303 aa  54.7  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2311  hypothetical protein  33.64 
 
 
303 aa  54.3  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000443541  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  27.52 
 
 
287 aa  54.3  0.0000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4560  hypothetical protein  29.63 
 
 
312 aa  53.9  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00353788  normal  0.103037 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1343  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.56 
 
 
294 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.9 
 
 
297 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0094  hypothetical protein  29.13 
 
 
290 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0098  hypothetical protein  29.13 
 
 
290 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1406  hypothetical protein  28.57 
 
 
324 aa  50.4  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.520748  normal  0.479385 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1754  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.21 
 
 
322 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.568137  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  29.17 
 
 
301 aa  50.1  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 
294 aa  49.3  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
310 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0444  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 
324 aa  48.9  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0243  hypothetical protein  30.63 
 
 
312 aa  48.5  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100372  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0716  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.89 
 
 
341 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.413764  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0230  hypothetical protein  30.58 
 
 
299 aa  48.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.331874 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.76 
 
 
325 aa  48.1  0.00008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2425  hypothetical protein  33.63 
 
 
313 aa  47.8  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.61547  normal  0.354813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  28 
 
 
315 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1573  hypothetical protein  28.97 
 
 
319 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  22.95 
 
 
308 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1011  hypothetical protein  28.85 
 
 
298 aa  47  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0158427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1803  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 
324 aa  47.4  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  30.37 
 
 
303 aa  47  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1584  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.85 
 
 
312 aa  47  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.317048 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1688  hypothetical protein  29.81 
 
 
286 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.757189 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  29.69 
 
 
301 aa  46.6  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.4 
 
 
306 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2363  hypothetical protein  29.46 
 
 
307 aa  46.2  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.847183  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2796  hypothetical protein  30.48 
 
 
293 aa  46.2  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0805  DMT family permease  27.64 
 
 
304 aa  46.2  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0378246 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  28.3 
 
 
296 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  26.55 
 
 
295 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2498  integral membrane protein  30.51 
 
 
306 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  30.89 
 
 
303 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  30.89 
 
 
303 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  27.34 
 
 
301 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  30.89 
 
 
303 aa  45.4  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  30.89 
 
 
303 aa  45.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0215  hypothetical protein  26.77 
 
 
334 aa  45.4  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  25 
 
 
310 aa  45.4  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4402  transmembrane protein  31.48 
 
 
306 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0849881  normal  0.180606 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  27.52 
 
 
312 aa  45.8  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2007  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.09 
 
 
303 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  30.08 
 
 
303 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2593  hypothetical protein  30.07 
 
 
297 aa  45.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688411  normal  0.697041 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  27.36 
 
 
296 aa  45.4  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  30.08 
 
 
303 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3864  hypothetical protein  27.93 
 
 
297 aa  44.7  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.209657  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 
308 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00646  permease  27.97 
 
 
317 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  26.72 
 
 
308 aa  44.7  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.36 
 
 
308 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  30.89 
 
 
303 aa  44.7  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3069  hypothetical protein  35.48 
 
 
293 aa  44.7  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.488834  normal  0.440663 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  27.1 
 
 
296 aa  43.9  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08620  predicted permease, DMT superfamily  27.73 
 
 
307 aa  44.3  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>