45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3031 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3031  hypothetical protein  100 
 
 		 299 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0401  hypothetical protein  37.63 
 
 		 336 aa  168  9e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0756989 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1567  DMT family permease  38.15 
 
 		 173 aa  129  7.000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3025  hypothetical protein  84.52 
 
 		 131 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.47992 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1568  hypothetical protein  37.72 
 
 		 114 aa  70.1  0.00000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1531  hypothetical protein  25.93 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0755616 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.16 
 
 		 315 aa  57  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0193  hypothetical protein  27.82 
 
 		 305 aa  52  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.677346 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1985  hypothetical protein  27.76 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3043  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.23 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.177704 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.21 
 
 		 309 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_002936  DET1056  hypothetical protein  28.35 
 
 		 287 aa  49.7  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.753909  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1197  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0260  DMT family permease  24.29 
 
 		 312 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3174  hypothetical protein  33 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3317  hypothetical protein  33 
 
 		 303 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3173  hypothetical protein  35.62 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  23.26 
 
 		 294 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  23.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  23.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  23.26 
 
 		 294 aa  47.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0791  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.88 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23.16 
 
 		 294 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  22.67 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4964  hypothetical protein  24.84 
 
 		 365 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.248208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0935  hypothetical protein  25.99 
 
 		 287 aa  46.2  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  22.09 
 
 		 294 aa  46.2  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.87 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 		 296 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0409  hypothetical protein  27.22 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  23.84 
 
 		 294 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3638  hypothetical protein  26.2 
 
 		 305 aa  44.7  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.603625  normal  0.524046 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3217  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.85 
 
 		 293 aa  44.3  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.182093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1692  hypothetical protein  23.3 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2094  hypothetical protein  32.73 
 
 		 309 aa  43.1  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0255656  normal  0.929791 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1442  hypothetical protein  25.31 
 
 		 342 aa  43.1  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.231485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4316  hypothetical protein  31.87 
 
 		 310 aa  43.1  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0816  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 259 aa  42.7  0.007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4050  hypothetical protein  31.87 
 
 		 310 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1132  hypothetical protein  30.99 
 
 		 310 aa  42.7  0.008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2007  hypothetical protein  29 
 
 		 291 aa  42.7  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28787  normal  0.56368 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3097  hypothetical protein  22.09 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.27047  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_924  transport protein  25.99 
 
 		 287 aa  42.4  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0491784  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.18 
 
 		 293 aa  42.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0304  hypothetical protein  22.9 
 
 		 273 aa  42.4  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.589486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>