218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1035 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1035  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 327 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0196  DMT family permease  27.42 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0224  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 317 aa  129  6e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0210  eama family protein  26.91 
 
 		 322 aa  129  6e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0206  EamA family protein  26.91 
 
 		 317 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0248  transporter, EamA family  27.24 
 
 		 322 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0192  DMT family permease  27.48 
 
 		 317 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0227  EamA family protein  26.91 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0189  hypothetical protein  25.91 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0231  transporter, EamA family  26.25 
 
 		 317 aa  125  9e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5096  transporter, EamA family  26.4 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4395  EamA family protein  27.95 
 
 		 314 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4549  EamA family protein  27.61 
 
 		 314 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4903  eama family protein  27.61 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4769  transporter, EamA family  27.61 
 
 		 314 aa  113  5e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3323  hypothetical protein  29.49 
 
 		 311 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.328853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4385  EamA family protein  28.52 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2132  transporter, EamA family  30 
 
 		 320 aa  108  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.405337  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2180  transporter EamA family  29.67 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.522746  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4788  EamA family protein  27.95 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4760  transporter, EamA family  28.48 
 
 		 314 aa  106  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.291181  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4786  transporter, EamA family  27.95 
 
 		 314 aa  105  8e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.198207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0475  transporter, EamA family  28.24 
 
 		 314 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.701719  hitchhiker  3.82339e-16 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0334  hypothetical protein  31.94 
 
 		 313 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3353  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.1 
 
 		 310 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3550  hypothetical protein  29.35 
 
 		 310 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0937  hypothetical protein  28.71 
 
 		 310 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0584  hypothetical protein  30.55 
 
 		 330 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3662  hypothetical protein  32.04 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186688 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3425  hypothetical protein  29.03 
 
 		 310 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2723  hypothetical protein  27.81 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.297419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0953  hypothetical protein  28.94 
 
 		 310 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.100703  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1702  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.71 
 
 		 302 aa  77.8  0.0000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.352845  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1857  hypothetical protein  27.87 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.943988  normal  0.125772 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3347  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.65 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00477347 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  26.71 
 
 		 325 aa  73.6  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1696  hypothetical protein  23.86 
 
 		 296 aa  73.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0904  hypothetical protein  25.41 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3900  hypothetical protein  27.95 
 
 		 341 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3090  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.33 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689039  normal  0.0602464 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0216  hypothetical protein  23.45 
 
 		 296 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.685922  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0738  DMT family permease  26.13 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000110425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0924  transporter, EamA family  26.64 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64365e-45 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1322  hypothetical protein  28.82 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.00901243  normal  0.345258 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0882  transporter, EamA family  26.33 
 
 		 303 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0755337  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0725  DMT family permease  26.13 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.123032  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4453  transporter, EamA family  26.33 
 
 		 303 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0045987  normal  0.86451 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0919  EamA family protein  26.64 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.23491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0993  transporter, EamA family  25.84 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00144449  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0739  hypothetical protein  25.44 
 
 		 303 aa  65.9  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159061  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0789  EamA family protein  25.78 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000376936  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0214  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.12 
 
 		 311 aa  65.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0679  hypothetical protein  26.16 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0829  eama family protein  25.78 
 
 		 303 aa  65.5  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000248571  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 301 aa  65.5  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3160  hypothetical protein  26.25 
 
 		 322 aa  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0739  hypothetical protein  31.29 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.354242  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  23.28 
 
 		 312 aa  63.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  28.15 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0463  hypothetical protein  23.47 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.3 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0897  hypothetical protein  27.03 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.631213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  26.07 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  27.66 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.53 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1374  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.41 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124016  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.38 
 
 		 291 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3545  hypothetical protein  27.68 
 
 		 297 aa  60.5  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1695  hypothetical protein  30.14 
 
 		 311 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0301  hypothetical protein  24.7 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000637282  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2645  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.58 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3897  hypothetical protein  25.75 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4094  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.45 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.466006  normal  0.380638 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3023  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 		 312 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.66818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0873  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.17 
 
 		 305 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4157  DMT family permease  25.08 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000489633  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0277  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.56 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4508  integral membrane protein  23.53 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563212  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4097  hypothetical protein  23.57 
 
 		 310 aa  57  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.913855 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4503  hypothetical protein  25.08 
 
 		 309 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00148993 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0473  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.65 
 
 		 317 aa  57  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0230422 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1309  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.4 
 
 		 299 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511844  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2701  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 312 aa  57  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0097  hypothetical protein  32.11 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.112407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1215  hypothetical protein  24.32 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1828  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.76 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000133968  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0644  protein of unknown function DUF6 transmembrane  20.2 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000380606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1999  hypothetical protein  26.1 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.355274  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0279  hypothetical protein  28.43 
 
 		 321 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2828  hypothetical protein  24.92 
 
 		 294 aa  55.5  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.474129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1521  hypothetical protein  21.53 
 
 		 266 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.851073  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.29 
 
 		 306 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1200  hypothetical protein  25.86 
 
 		 311 aa  55.1  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.380417  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2528  hypothetical protein  27.49 
 
 		 289 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00740472  normal  0.181025 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  26.71 
 
 		 315 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27080  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  29.1 
 
 		 309 aa  53.9  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29710  hypothetical protein  26.47 
 
 		 310 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299323  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1277  hypothetical protein  27.18 
 
 		 310 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.507228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 		 320 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5288  hypothetical protein  28.57 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>