35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0431 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0431  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  176  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  90.22 
 
 
319 aa  141  4e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  73.91 
 
 
319 aa  128  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  65.22 
 
 
320 aa  107  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  59.77 
 
 
311 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  63.74 
 
 
314 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6570  hypothetical protein  62.64 
 
 
316 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.393923  normal  0.0435582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  58.33 
 
 
301 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  53.16 
 
 
304 aa  83.6  9e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  54.02 
 
 
307 aa  79  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  47.62 
 
 
308 aa  72  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  45.98 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  43.68 
 
 
321 aa  61.2  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  43.68 
 
 
321 aa  60.8  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 
305 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  42.65 
 
 
305 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  38.37 
 
 
301 aa  54.7  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0388  hypothetical protein  39.71 
 
 
320 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  37.35 
 
 
299 aa  50.8  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.85 
 
 
313 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.96 
 
 
307 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  32.39 
 
 
304 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5366  putative inner membrane transport protein of unknown function  41.18 
 
 
297 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00165583 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  41.18 
 
 
301 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  44.44 
 
 
290 aa  48.9  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0049  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.76 
 
 
304 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0356674 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.25 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.33 
 
 
301 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.56 
 
 
301 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6931  hypothetical protein  36.76 
 
 
306 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.836201  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0592  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.62 
 
 
300 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.174316  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  31.11 
 
 
311 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1070  hypothetical protein  32.39 
 
 
310 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  40 
 
 
297 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  35.21 
 
 
364 aa  40  0.01  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>