More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4412 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4412  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.498323  normal  0.446109 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  30.41 
 
 		 319 aa  103  5e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  31.33 
 
 		 297 aa  93.6  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.05 
 
 		 319 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  30.77 
 
 		 298 aa  91.7  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  27.49 
 
 		 310 aa  92  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  26.57 
 
 		 290 aa  89.4  7e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4198  hypothetical protein  32.16 
 
 		 307 aa  85.1  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00727451  normal  0.657749 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  30.07 
 
 		 311 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.02 
 
 		 326 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  30.31 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  32.42 
 
 		 301 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  31.63 
 
 		 298 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  24.04 
 
 		 302 aa  82.4  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 310 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.45 
 
 		 335 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.27 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.86 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.37 
 
 		 297 aa  80.5  0.00000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2347  hypothetical protein  27.61 
 
 		 290 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  28.17 
 
 		 303 aa  80.1  0.00000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0225  hypothetical protein  27.8 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.490189  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1839  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.33 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.78 
 
 		 298 aa  78.2  0.0000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.82 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  27.02 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0398  hypothetical protein  28.67 
 
 		 319 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.799328 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0392  ABC transporter membrane spanning protein  26.57 
 
 		 301 aa  74.7  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.95 
 
 		 298 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  26.04 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  28.47 
 
 		 310 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1638  hypothetical protein  31.34 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.350443 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.3 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  29.25 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0008  drug/metabolite exporter (DME) family protein  31.34 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  31.4 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  31.4 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  31.06 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  26.52 
 
 		 300 aa  72.4  0.000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2763  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.11 
 
 		 304 aa  72  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1591  hypothetical protein  28.67 
 
 		 305 aa  72  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.12309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1744  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.87 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.96 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1843  hypothetical protein  28.72 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.104573 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.86 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  28.28 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  30.51 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1578  hypothetical protein  26.1 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.664968  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 367 aa  70.5  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.19 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3379  transporter, EamA family  21.03 
 
 		 294 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  28.67 
 
 		 299 aa  70.1  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  23.89 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4793  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.5 
 
 		 300 aa  69.7  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1673  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.12 
 
 		 324 aa  69.7  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0860474  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0197  hypothetical protein  28.47 
 
 		 356 aa  69.7  0.00000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  28.32 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  26.95 
 
 		 379 aa  69.3  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3995  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.78 
 
 		 305 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.59 
 
 		 308 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2416  hypothetical protein  27.27 
 
 		 299 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0994864  normal  0.0254261 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  25.44 
 
 		 302 aa  67.8  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3405  transporter, EamA family  20.34 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3158  EamA family protein  21.03 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1853  transporter, EamA family  23 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3393  transporter, EamA family  20.69 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  25.5 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3174  EamA family protein  20.69 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3424  eama family protein  20.69 
 
 		 294 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.02 
 
 		 306 aa  66.2  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2912  hypothetical protein  26.06 
 
 		 301 aa  65.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2918  hypothetical protein  27.93 
 
 		 315 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.103188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0297  hypothetical protein  26.3 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  28.97 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  28.97 
 
 		 308 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3401  integral membrane protein  20 
 
 		 294 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.531981  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.08 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  30.18 
 
 		 308 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  28.67 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  23.3 
 
 		 304 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1029  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.9 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0129  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.08 
 
 		 283 aa  64.7  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3004  hypothetical protein  29.83 
 
 		 308 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  26.39 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  27.49 
 
 		 288 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2460  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.71 
 
 		 330 aa  63.2  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.130133  hitchhiker  0.00000322546 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  26.92 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.92 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  23.29 
 
 		 305 aa  62.4  0.000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0502  hypothetical protein  29.51 
 
 		 301 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.643088  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  26.62 
 
 		 302 aa  62  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  27.34 
 
 		 289 aa  62  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.23 
 
 		 324 aa  62  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3034  hypothetical protein  25.77 
 
 		 298 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317947  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1099  hypothetical protein  27.37 
 
 		 296 aa  62.4  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.241539 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1524  hypothetical protein  25.34 
 
 		 312 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.499904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>