More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2391 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2391  protein of unknown function DUF6 transmembrane  100 
 
 		 302 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0570975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1542  hypothetical protein  41.78 
 
 		 288 aa  175  7e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.545478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02645  Predicted permease  38.23 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.880959  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0388  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.12 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0581  hypothetical protein  32.23 
 
 		 280 aa  131  1.0000000000000001e-29  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2053  integral membrane protein DUF6  30.14 
 
 		 302 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1636  hypothetical protein  29.24 
 
 		 335 aa  94.7  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2371  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.47 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.599012 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2775  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 310 aa  92.8  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  29.82 
 
 		 298 aa  91.7  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0553  hypothetical protein  29.35 
 
 		 301 aa  89.4  8e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636071 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1099  hypothetical protein  30.29 
 
 		 310 aa  87  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.230747  normal  0.557471 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0987  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.55 
 
 		 310 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2507  hypothetical protein  28.36 
 
 		 310 aa  80.5  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0165619 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0050  hypothetical protein  29.93 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0199  hypothetical protein  26.17 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3002  hypothetical protein  28.87 
 
 		 298 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5528  hypothetical protein  29.15 
 
 		 311 aa  79.3  0.00000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5748  hypothetical protein  27.21 
 
 		 303 aa  78.6  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3867  hypothetical protein  28.85 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16131  integral membrane protein, DUF6  29.39 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.396242 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2825  hypothetical protein  28.99 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0965979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.15 
 
 		 319 aa  77  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1468  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.42 
 
 		 303 aa  76.3  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3363  hypothetical protein  30.97 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.298579  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1731  hypothetical protein  29.82 
 
 		 379 aa  76.3  0.0000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3877  hypothetical protein  27.37 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.421169  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2136  hypothetical protein  27.27 
 
 		 297 aa  75.1  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2562  hypothetical protein  26.71 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0693579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3091  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.2 
 
 		 309 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2143  putative transmembrane protein  26.24 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06582  hypothetical protein  27.53 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1102  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.624335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1102  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2341  hypothetical protein  25.08 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0925779 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2018  hypothetical protein  28.41 
 
 		 312 aa  72  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.172167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.41 
 
 		 312 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.297612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0913  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.22 
 
 		 326 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.93 
 
 		 301 aa  70.1  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3541  hypothetical protein  26.62 
 
 		 295 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0739  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1220  hypothetical protein  27.56 
 
 		 308 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.10196  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1242  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.91 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.305657  normal  0.0923117 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6436  hypothetical protein  26.73 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2091  hypothetical protein  27.93 
 
 		 301 aa  68.6  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2561  hypothetical protein  28.05 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.372127  normal  0.570077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03890  probable transmembrane protein  26.82 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1105  hypothetical protein  30.8 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3728  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.8 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.952098  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0716  hypothetical protein  26.51 
 
 		 313 aa  67  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.209538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1192  hypothetical protein  27.21 
 
 		 308 aa  67  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.164294  normal  0.262505 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4566  hypothetical protein  28.22 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6523  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.38 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1323  hypothetical protein  28.22 
 
 		 291 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5126  hypothetical protein  29.51 
 
 		 289 aa  66.6  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0428934  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1522  hypothetical protein  26.69 
 
 		 324 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.860733  normal  0.405706 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4078  hypothetical protein  28.12 
 
 		 317 aa  65.9  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.958621  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0251  hypothetical protein  25.17 
 
 		 305 aa  65.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1194  hypothetical protein  27.3 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00865316  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2203  hypothetical protein  28.47 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.129513  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0184  integral membrane protein  29.26 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0996996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2576  hypothetical protein  26.06 
 
 		 329 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.398851 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1763  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.272283  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0477  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2674  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.41 
 
 		 308 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0675  hypothetical protein  26.98 
 
 		 310 aa  63.2  0.000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00975957  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1858  hypothetical protein  27.82 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2617  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 		 301 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2847  hypothetical protein  27.05 
 
 		 310 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1445  DMT family permease  26.43 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.658793  normal  0.0652074 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2044  ABC transporter membrane spanning protein  27.65 
 
 		 304 aa  62.4  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.52 
 
 		 306 aa  62.4  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1392  multidrug ABC transporter permease  26.62 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1791  hypothetical protein  25.69 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.82082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1398  hypothetical protein  26.62 
 
 		 310 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.974177  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2468  hypothetical protein  27.97 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0312814  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4664  EamA family protein  27.31 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4505  EamA family protein  27.31 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4521  EamA family protein  27.31 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4328  hypothetical protein  26.55 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5024  eama family protein  27.31 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.333831  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4890  transporter, EamA family  27.31 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1109  hypothetical protein  29.56 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.12045 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4780  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.9 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.8061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6765  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.57 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0325533  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1258  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.37 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0065  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.02 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2304  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  59.7  0.00000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1524  DMT family permease  25.27 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3441  hypothetical protein  25.09 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0018566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1417  hypothetical protein  26.46 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1877  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.17 
 
 		 367 aa  59.3  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.307574  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0646  hypothetical protein  22.18 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2694  transporter, EamA family  26.72 
 
 		 304 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.680724  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3092  EamA family protein  24.67 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00288744  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0593  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 283 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1842  DMT family permease  27.61 
 
 		 324 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3882  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.86 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.412481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2084  hypothetical protein  24.47 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4910  transporter, EamA family  27.55 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>