More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0666 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0666  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3772  hypothetical protein  91.42 
 
 
306 aa  506  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.758129  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2368  hypothetical protein  58.95 
 
 
311 aa  341  8e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  56.07 
 
 
291 aa  304  2.0000000000000002e-81  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  35.69 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.1 
 
 
328 aa  145  9e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  33.67 
 
 
318 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 
313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  33.11 
 
 
317 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  35.34 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.99 
 
 
317 aa  123  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0858  RhaT family transporter  32.19 
 
 
317 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2517  hypothetical protein  32.19 
 
 
317 aa  122  7e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.85 
 
 
305 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.83 
 
 
305 aa  120  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  31.21 
 
 
310 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  31.42 
 
 
315 aa  119  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  30.96 
 
 
302 aa  117  3e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  32.31 
 
 
311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.8 
 
 
314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0424  DMT family permease  32.19 
 
 
305 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.49 
 
 
318 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  30.21 
 
 
331 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  34.93 
 
 
317 aa  107  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.53 
 
 
318 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  32.05 
 
 
309 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3586  hypothetical protein  30.31 
 
 
299 aa  102  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0070  hypothetical protein  33.09 
 
 
331 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.215988  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  27.68 
 
 
301 aa  100  3e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
305 aa  100  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  30.94 
 
 
309 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  31.86 
 
 
320 aa  98.2  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0355  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.923959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0341  hypothetical protein  30.82 
 
 
308 aa  97.8  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.514286 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0175  hypothetical protein  29.5 
 
 
281 aa  97.8  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.812407  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3987  hypothetical protein  32.4 
 
 
309 aa  97.8  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.279152 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0156  hypothetical protein  29.33 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.294912  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3834  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.47 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  30.03 
 
 
320 aa  97.1  4e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  30.49 
 
 
297 aa  96.3  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  27.21 
 
 
303 aa  96.3  6e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1379  permease  30.03 
 
 
317 aa  96.3  6e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.139732  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1711  RhaT family protein  30.58 
 
 
308 aa  96.3  6e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.466454  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  30.58 
 
 
306 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.67 
 
 
318 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  29.21 
 
 
319 aa  95.5  9e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  29.12 
 
 
291 aa  95.5  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2932  permease  27.27 
 
 
342 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  29.17 
 
 
306 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2071  hypothetical protein  28.62 
 
 
297 aa  93.2  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  28.78 
 
 
279 aa  93.2  5e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0714  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 
322 aa  92.8  6e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  26.62 
 
 
317 aa  92.8  7e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  31.78 
 
 
294 aa  92.8  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  30.88 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4162  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.53 
 
 
316 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  32.56 
 
 
294 aa  92  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  32.56 
 
 
294 aa  91.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.33 
 
 
325 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  27.62 
 
 
289 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.17 
 
 
306 aa  92  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  28.98 
 
 
297 aa  92  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  30.85 
 
 
307 aa  91.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  30.7 
 
 
316 aa  91.3  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3378  hypothetical protein  28.47 
 
 
314 aa  90.1  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.804952  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  29.58 
 
 
289 aa  89.7  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  29.51 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  28.92 
 
 
295 aa  89  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  30.9 
 
 
294 aa  88.6  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  30.15 
 
 
285 aa  87.8  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  27.05 
 
 
288 aa  87.8  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  30.9 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0408  integral membrane protein  30.89 
 
 
289 aa  87  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00379615  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1887  hypothetical protein  29.5 
 
 
310 aa  87  3e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0932  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.34 
 
 
312 aa  87  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0197458  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3068  hypothetical protein  30 
 
 
299 aa  87  4e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.237981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2143  drug/metabolite exporter family protein  31.23 
 
 
297 aa  87  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000798469  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  30.31 
 
 
319 aa  87  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  26.96 
 
 
313 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.000000753467  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3812  hypothetical protein  27.72 
 
 
323 aa  86.3  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2847  hypothetical protein  31.94 
 
 
293 aa  85.9  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0250  hypothetical protein  28.67 
 
 
304 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0643  hypothetical protein  24.91 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.254759  normal  0.394325 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0238  hypothetical protein  30.38 
 
 
324 aa  85.9  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.745295 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0751  hypothetical protein  29.55 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.27541 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1081  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.72 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.83 
 
 
293 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1965  hypothetical protein  29.41 
 
 
324 aa  85.1  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.124551  normal  0.159447 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0908  hypothetical protein  29.67 
 
 
300 aa  84.7  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.144384  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  31.12 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  28.92 
 
 
285 aa  84  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  29.18 
 
 
295 aa  84  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  31.41 
 
 
292 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00760  hypothetical protein  30.9 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  31.51 
 
 
289 aa  83.2  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  31.27 
 
 
311 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  27.74 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0570  hypothetical protein  29.23 
 
 
314 aa  82.4  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  28.57 
 
 
286 aa  82.4  0.000000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2646  hypothetical protein  30.51 
 
 
318 aa  82.4  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>