69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_2091 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  578  1e-164  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  76.82 
 
 		 290 aa  403  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  46.21 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  46.21 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2525  hypothetical protein  46.07 
 
 		 286 aa  202  4e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  40.81 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  40.81 
 
 		 282 aa  196  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  69.63 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.63 
 
 		 286 aa  70.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  24.31 
 
 		 290 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  25.78 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  27.02 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  26.74 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  23.08 
 
 		 327 aa  60.1  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.61 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  22.33 
 
 		 290 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.35 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.37 
 
 		 293 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  29 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  27.35 
 
 		 279 aa  57  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.47 
 
 		 281 aa  56.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  22.3 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.68 
 
 		 293 aa  53.5  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.63 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  22.84 
 
 		 287 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  22.95 
 
 		 278 aa  50.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  21.13 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  25.09 
 
 		 278 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  22.66 
 
 		 281 aa  50.8  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  22.26 
 
 		 288 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  22.11 
 
 		 285 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  24.47 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  23.49 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  22.34 
 
 		 303 aa  48.5  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 306 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  21.11 
 
 		 280 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  23.49 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  26.54 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  24.2 
 
 		 284 aa  47.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  23.71 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  23.55 
 
 		 295 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  23.71 
 
 		 278 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  28.46 
 
 		 280 aa  47  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.25 
 
 		 273 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.23 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  22.7 
 
 		 285 aa  47.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  22.41 
 
 		 302 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  21.89 
 
 		 293 aa  47  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  25.9 
 
 		 308 aa  47  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  24.48 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3717  hypothetical protein  25.17 
 
 		 283 aa  46.2  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657811  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  22.97 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  23.42 
 
 		 293 aa  44.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  24.07 
 
 		 290 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5906  hypothetical protein  22.54 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  26.46 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  22.32 
 
 		 251 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4318  hypothetical protein  24.43 
 
 		 301 aa  43.9  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  24.57 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4376  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.81 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124174  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3346  hypothetical protein  40.62 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.254726 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1807  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.68 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.805576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  23.11 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  24.05 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  23.01 
 
 		 290 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50670  hypothetical protein  23.39 
 
 		 301 aa  43.1  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0191207 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2704  protein of unknown function DUF6 transmembrane  39.06 
 
 		 297 aa  42.7  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1447  hypothetical protein  24.31 
 
 		 301 aa  42.4  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.23861  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>