72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3683 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3683  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  572  1.0000000000000001e-162  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2091  hypothetical protein  76.82 
 
 		 290 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3662  metal-dependent hydrolase involved in phosphonate metabolism-like protein  86.03 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0468  hypothetical protein  45.82 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.784774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0433  hypothetical protein  45.82 
 
 		 288 aa  224  9e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4046  hypothetical protein  41.54 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0226  hypothetical protein  41.54 
 
 		 282 aa  192  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2525  hypothetical protein  44.57 
 
 		 286 aa  191  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.482024 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4689  hypothetical protein  26.1 
 
 		 285 aa  60.5  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4302  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.07 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2949  hypothetical protein  23.79 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.191447 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0810  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.03 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.617842  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2742  hypothetical protein  26.6 
 
 		 308 aa  57.4  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1239  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.570084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5448  hypothetical protein  22.3 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1129  hypothetical protein  23.91 
 
 		 288 aa  56.2  0.0000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.475409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1099  hypothetical protein  27.57 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.112723 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0149  hypothetical protein  25.27 
 
 		 332 aa  56.2  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.376586  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0881  hypothetical protein  24.11 
 
 		 303 aa  55.5  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.443506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1930  putative integral membrane protein DUF6  24.5 
 
 		 279 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211906  hitchhiker  0.0000000927699 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0944  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.75 
 
 		 281 aa  55.5  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.632965 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0853  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 290 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3089  hypothetical protein  29.39 
 
 		 280 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2052  hypothetical protein  23.16 
 
 		 290 aa  54.7  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00300116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0806  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.75 
 
 		 290 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000304842  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1643  hypothetical protein  22.79 
 
 		 290 aa  53.5  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157651  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1927  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.57 
 
 		 277 aa  53.5  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.642083  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2138  hypothetical protein  23.4 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.186321  normal  0.806194 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3482  hypothetical protein  30.53 
 
 		 290 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.183799 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3474  DMT family permease  25.22 
 
 		 280 aa  52.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4117  protein of unknown function DUF6 transmembrane  22.15 
 
 		 293 aa  52.8  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1761  hypothetical protein  26.04 
 
 		 290 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0150156  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3756  hypothetical protein  22.26 
 
 		 285 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.83129  normal  0.119763 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4521  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.07 
 
 		 278 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1326  putative permease protein  23.71 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3577  hypothetical protein  25.36 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04883  hypothetical protein  25.69 
 
 		 301 aa  49.7  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2580  hypothetical protein  23.53 
 
 		 281 aa  49.7  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.527852  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000762  permease  25.5 
 
 		 302 aa  49.3  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0865  hypothetical protein  24.81 
 
 		 295 aa  49.3  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0566496  normal  0.513013 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3366  hypothetical protein  23.59 
 
 		 278 aa  49.3  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1649  DMT family permease  30.65 
 
 		 290 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.799428  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0836  hypothetical protein  26.54 
 
 		 278 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.217739 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0541  hypothetical protein  25.17 
 
 		 301 aa  48.5  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4620  hypothetical protein  25.18 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.331328 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5359  hypothetical protein  24.88 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4709  hypothetical protein  25.56 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.328299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3007  hypothetical protein  24.88 
 
 		 278 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.558663  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_6007  hypothetical protein  22.87 
 
 		 287 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0706  hypothetical protein  25.34 
 
 		 281 aa  47.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.294779  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2841  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.55 
 
 		 306 aa  47  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0697  hypothetical protein  25.34 
 
 		 281 aa  47  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2290  hypothetical protein  27.96 
 
 		 275 aa  46.6  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.825928 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3629  hypothetical protein  22.22 
 
 		 293 aa  46.6  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.539858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1866  hypothetical protein  29.84 
 
 		 290 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4911  hypothetical protein  24.54 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4020  hypothetical protein  21.84 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.799358  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0011  hypothetical protein  23.51 
 
 		 280 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4347  hypothetical protein  21.84 
 
 		 285 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0286  hypothetical protein  24.32 
 
 		 293 aa  45.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4230  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.220159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5239  hypothetical protein  25.35 
 
 		 278 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3416  hypothetical protein  21.95 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4193  putative 10 TMS drug/metabolite exporter, DME family, DMT superfamily  25.84 
 
 		 280 aa  44.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0556115 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4271  hypothetical protein  21.88 
 
 		 285 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.564552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4376  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.02 
 
 		 294 aa  43.9  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.124174  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5892  hypothetical protein  23.87 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3034  hypothetical protein  23.57 
 
 		 299 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1673  hypothetical protein  23.45 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0779725  normal  0.510796 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3337  hypothetical protein  23.59 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0532  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.87 
 
 		 273 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0613856  normal  0.397799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  23.26 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>