235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1966 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1966  amidohydrolase  100 
 
 		 442 aa  896    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3671  amidohydrolase  36.59 
 
 		 428 aa  202  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  30.72 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  31.55 
 
 		 413 aa  157  3e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  28.7 
 
 		 436 aa  146  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  32.19 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  31.71 
 
 		 411 aa  143  5e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  32.79 
 
 		 418 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  32.82 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  30.57 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  28.43 
 
 		 407 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  27.36 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  29.95 
 
 		 416 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  32.18 
 
 		 419 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  134  1.9999999999999998e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  27.15 
 
 		 412 aa  133  5e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  30.38 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  31.81 
 
 		 482 aa  131  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  30.34 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  31.15 
 
 		 411 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  31.49 
 
 		 419 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  28.12 
 
 		 421 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  31.09 
 
 		 461 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  29.08 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  30.54 
 
 		 405 aa  126  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  29.98 
 
 		 411 aa  126  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  28.67 
 
 		 408 aa  126  8.000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0275  amidohydrolase  29.95 
 
 		 413 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.362841 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  28.07 
 
 		 407 aa  124  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  27.67 
 
 		 426 aa  122  9e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2515  amidohydrolase  30.63 
 
 		 426 aa  122  1.9999999999999998e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  28.81 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  28.18 
 
 		 406 aa  120  3e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  26.94 
 
 		 478 aa  121  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  28.74 
 
 		 425 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  28.85 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  27.87 
 
 		 434 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  28.18 
 
 		 432 aa  119  9e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  31.27 
 
 		 444 aa  119  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  32.06 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  29.43 
 
 		 411 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  29.79 
 
 		 407 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  28.25 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  31 
 
 		 411 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1238  amidohydrolase  29.85 
 
 		 444 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0871897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  28.47 
 
 		 445 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  27.11 
 
 		 447 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.98 
 
 		 412 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3194  hypothetical protein  28.01 
 
 		 447 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.352282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1229  amidohydrolase  25.53 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6603  amidohydrolase  25.53 
 
 		 423 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.18808  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0159  amidohydrolase  29.05 
 
 		 415 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6063  amidohydrolase  26.12 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.233217  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  27.78 
 
 		 430 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  30.94 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  30.33 
 
 		 415 aa  114  5e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.472075 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1893  amidohydrolase  29.89 
 
 		 409 aa  113  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.342109 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  29.36 
 
 		 409 aa  113  9e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0462  amidohydrolase  30.22 
 
 		 401 aa  111  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000842595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  30.24 
 
 		 436 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  28.54 
 
 		 426 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1913  amidohydrolase  29.66 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.406706  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  29.37 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5037  amidohydrolase  30.47 
 
 		 432 aa  110  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1959  amidohydrolase  29.66 
 
 		 409 aa  110  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5997  Cytosine deaminase-like metal-dependent amidohydrolase  24.94 
 
 		 443 aa  110  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.75686  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  27.03 
 
 		 445 aa  109  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  28.95 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2377  amidohydrolase  28.89 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.134161  normal  0.652305 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  27.21 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  30.68 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  27.36 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  29.37 
 
 		 413 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  26.18 
 
 		 430 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  30.05 
 
 		 424 aa  107  5e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  28.19 
 
 		 444 aa  107  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  30.39 
 
 		 419 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3368  amidohydrolase  30.22 
 
 		 414 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.929128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1852  imidazolonepropionase related amidohydrolase  26.19 
 
 		 410 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  25.52 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  28.42 
 
 		 447 aa  104  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1413  amidohydrolase  28.64 
 
 		 423 aa  104  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  30.15 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  30.2 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  27.95 
 
 		 456 aa  104  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  30.15 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  30.2 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  30.15 
 
 		 417 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  30.2 
 
 		 408 aa  104  3e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.23 
 
 		 434 aa  103  4e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  29.3 
 
 		 413 aa  104  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  28.64 
 
 		 420 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.3 
 
 		 413 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  29.66 
 
 		 402 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2208  amidohydrolase  25.47 
 
 		 440 aa  103  8e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00166067 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02779  conserved hypothetical protein  27.85 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.243832  normal  0.291851 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  27.74 
 
 		 455 aa  102  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  26.82 
 
 		 428 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  27.23 
 
 		 451 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  28.3 
 
 		 433 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>