More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3384 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3384  WD40 domain protein beta Propeller  100 
 
 		 398 aa  776    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.749473  normal  0.131149 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  35.37 
 
 		 1005 aa  84.3  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  36.87 
 
 		 1031 aa  80.5  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  31.69 
 
 		 572 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  30.95 
 
 		 717 aa  77.4  0.0000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  32.04 
 
 		 1014 aa  77.4  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1346  translocation protein TolB  29.87 
 
 		 421 aa  77  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.73 
 
 		 430 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  34.36 
 
 		 590 aa  75.9  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1229  translocation protein TolB  36.23 
 
 		 424 aa  74.7  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.910184  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  29.02 
 
 		 1040 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0446  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.92 
 
 		 2741 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  29.02 
 
 		 1042 aa  73.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  33.53 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1042 aa  72.8  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  28.32 
 
 		 415 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  33.7 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  27.92 
 
 		 427 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.1 
 
 		 298 aa  72  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  33.7 
 
 		 434 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  30.05 
 
 		 435 aa  71.2  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  29.38 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  29.88 
 
 		 1059 aa  71.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.34 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  30.56 
 
 		 446 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  25.86 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  30.28 
 
 		 969 aa  68.6  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3406  translocation protein TolB  25.35 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.569267 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  34.57 
 
 		 1010 aa  68.2  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  30.65 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  26.44 
 
 		 430 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0275  translocation protein TolB  29.48 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00839364  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0462  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.3 
 
 		 2741 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0776  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  26.22 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.605794  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  31.28 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0145  translocation protein TolB  29.35 
 
 		 434 aa  67  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.76 
 
 		 407 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  30.09 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  33.81 
 
 		 437 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  29.8 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  26.29 
 
 		 429 aa  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_010681  Bphyt_0759  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 430 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.397862  normal  0.413932 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3920  translocation protein TolB  27.4 
 
 		 430 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0501302 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  31.66 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  33.81 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0303  translocation protein TolB  29.34 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.307961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  26.49 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  26.39 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0012  WD40 domain-containing protein  30.24 
 
 		 620 aa  64.7  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2102  WD40 domain protein beta Propeller  38.79 
 
 		 1078 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.18 
 
 		 407 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3394  translocation protein TolB  25.52 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  30.59 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  32.64 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1737  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.61 
 
 		 1021 aa  63.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.349792  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0446  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.69 
 
 		 340 aa  64.3  0.000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  26.83 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1277  translocation protein TolB  31.1 
 
 		 432 aa  64.3  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.154906  normal  0.476044 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2092  translocation protein TolB  25.64 
 
 		 425 aa  63.9  0.000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.626129  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.73 
 
 		 440 aa  63.2  0.000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2193  WD40 domain protein beta Propeller  36.75 
 
 		 1077 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0728  translocation protein TolB  28 
 
 		 434 aa  63.2  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00650912  normal  0.160751 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  30.43 
 
 		 444 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  28.82 
 
 		 1097 aa  63.2  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1981  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  34.53 
 
 		 432 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1011  translocation protein TolB  25.57 
 
 		 421 aa  62.4  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0684  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672983  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  27.51 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  40.37 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1984  translocation protein TolB  28.04 
 
 		 426 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.517365  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  29.36 
 
 		 1028 aa  62.4  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  29.59 
 
 		 453 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1723  translocation protein TolB  25.23 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0502645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  32.13 
 
 		 427 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  31.09 
 
 		 1167 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  39.45 
 
 		 442 aa  62  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1730  WD40 domain protein beta Propeller  34.3 
 
 		 982 aa  61.6  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.16258  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  30.49 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  32 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  32 
 
 		 423 aa  62  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 433 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  28.52 
 
 		 347 aa  61.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  23.55 
 
 		 656 aa  61.2  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0795  translocation protein TolB  25.25 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4536  translocation protein TolB  31.88 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  29.29 
 
 		 445 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  31.33 
 
 		 423 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  26.04 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0270  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  27.93 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.989147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  35.51 
 
 		 615 aa  60.8  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1354  WD40 domain-containing protein  24.69 
 
 		 489 aa  60.8  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00427264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  25.19 
 
 		 1951 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  24.39 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.61 
 
 		 446 aa  60.8  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 		 642 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.48 
 
 		 445 aa  60.5  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0566  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.82 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.22163  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>