265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3411 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  88.85 
 
 		 1094 aa  2043    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  100 
 
 		 1094 aa  2251    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  70.08 
 
 		 1092 aa  1617    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  88.48 
 
 		 1094 aa  2029    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  94.42 
 
 		 1093 aa  2144    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  94.33 
 
 		 1093 aa  2145    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  70.13 
 
 		 1094 aa  1587    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  94.33 
 
 		 1093 aa  2142    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  64.59 
 
 		 1084 aa  1474    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  70.48 
 
 		 1097 aa  1610    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  88.66 
 
 		 1094 aa  2038    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  88.67 
 
 		 1094 aa  2033    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  70.2 
 
 		 1104 aa  1606    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  88.76 
 
 		 1094 aa  2034    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  72.69 
 
 		 1094 aa  1665    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.79 
 
 		 1167 aa  445  1e-123  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.78 
 
 		 1117 aa  430  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.37 
 
 		 1104 aa  426  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.66 
 
 		 1089 aa  426  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  30.19 
 
 		 1059 aa  405  1e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.53 
 
 		 1079 aa  395  1e-108  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  26.43 
 
 		 1075 aa  379  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  29.29 
 
 		 1016 aa  379  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.11 
 
 		 1065 aa  368  1e-100  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  27.78 
 
 		 1069 aa  340  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  26.49 
 
 		 1147 aa  316  1.9999999999999998e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  31.38 
 
 		 1181 aa  316  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  30.45 
 
 		 1183 aa  303  1e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.37 
 
 		 1051 aa  300  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  26.68 
 
 		 1107 aa  299  2e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  28.02 
 
 		 1008 aa  297  8e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  35.76 
 
 		 1545 aa  248  4.9999999999999997e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  35.54 
 
 		 1545 aa  246  1.9999999999999999e-63  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  24.93 
 
 		 1067 aa  242  2.9999999999999997e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.31 
 
 		 1082 aa  229  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.22 
 
 		 1090 aa  221  7.999999999999999e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.52 
 
 		 1186 aa  219  2e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.59 
 
 		 1125 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  22.9 
 
 		 1097 aa  199  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  43.64 
 
 		 1484 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  21.29 
 
 		 1084 aa  163  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  24.72 
 
 		 1193 aa  153  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.15 
 
 		 1076 aa  142  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.8 
 
 		 1354 aa  122  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.56 
 
 		 425 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.23 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.98 
 
 		 483 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.62 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.98 
 
 		 465 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.74 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  22.76 
 
 		 427 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  29.37 
 
 		 416 aa  72  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.43 
 
 		 472 aa  68.6  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  24.6 
 
 		 431 aa  65.5  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.72 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.41 
 
 		 397 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25 
 
 		 457 aa  63.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 		 496 aa  60.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 		 496 aa  60.8  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  23.68 
 
 		 444 aa  60.8  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.46 
 
 		 401 aa  60.1  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  34.25 
 
 		 440 aa  60.1  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  25.1 
 
 		 484 aa  59.3  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  22.66 
 
 		 1062 aa  58.9  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  23.68 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5656  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 478 aa  58.9  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 444 aa  58.5  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  22.49 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5288  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.6 
 
 		 402 aa  58.2  0.0000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4877  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.47448  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5032  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.62972  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4862  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5414  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 469 aa  58.2  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5270  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5345  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 478 aa  58.2  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  24.84 
 
 		 377 aa  57.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2074  carboxy-terminal protease  26.94 
 
 		 673 aa  57.4  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1354  peptidase S41  25 
 
 		 367 aa  57.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.405316  normal  0.73839 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5300  carboxyl-terminal protease  23.93 
 
 		 478 aa  57.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  23.92 
 
 		 433 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  24.03 
 
 		 418 aa  57.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  25.34 
 
 		 664 aa  57.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.46 
 
 		 429 aa  57  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  23.13 
 
 		 1071 aa  56.2  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  23.85 
 
 		 480 aa  56.2  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 444 aa  56.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4976  carboxyl-terminal protease  24.41 
 
 		 478 aa  55.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  22.22 
 
 		 1138 aa  55.8  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.28 
 
 		 430 aa  55.8  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  22.08 
 
 		 434 aa  55.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1812  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 478 aa  55.5  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.1 
 
 		 431 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1812  carboxyl-terminal protease  25.93 
 
 		 682 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.412935  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1802  carboxy-terminal protease  25.93 
 
 		 682 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0594829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.92 
 
 		 426 aa  55.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1921  carboxy-terminal protease  25.93 
 
 		 682 aa  55.1  0.000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000149225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>