159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_1608 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  76.97 
 
 		 1181 aa  1816    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  100 
 
 		 1183 aa  2363    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  50.85 
 
 		 1069 aa  635    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  34.51 
 
 		 1104 aa  633  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  35.85 
 
 		 1117 aa  627  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  48.56 
 
 		 1051 aa  601  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  35.49 
 
 		 1089 aa  582  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  42.68 
 
 		 1147 aa  562  1e-158  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  42.42 
 
 		 1186 aa  511  1e-143  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  41.95 
 
 		 1107 aa  476  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  39.2 
 
 		 1059 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  32.91 
 
 		 1065 aa  412  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  32.03 
 
 		 1016 aa  400  9.999999999999999e-111  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  30.85 
 
 		 1008 aa  326  1e-87  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  30.81 
 
 		 1079 aa  323  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  29.79 
 
 		 1075 aa  319  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  30.82 
 
 		 1094 aa  313  1e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  31.31 
 
 		 1093 aa  311  5e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  30.82 
 
 		 1094 aa  311  5e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  30.65 
 
 		 1093 aa  310  8e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  30.82 
 
 		 1094 aa  310  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  30.52 
 
 		 1093 aa  308  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  30.69 
 
 		 1094 aa  307  8.000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  30.85 
 
 		 1097 aa  306  1.0000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  30.16 
 
 		 1094 aa  304  8.000000000000001e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  30.45 
 
 		 1094 aa  303  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  33.04 
 
 		 1167 aa  302  3e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  25.17 
 
 		 1354 aa  301  4e-80  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  29.78 
 
 		 1092 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  32.39 
 
 		 1084 aa  291  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  29.39 
 
 		 1094 aa  280  9e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  30.62 
 
 		 1104 aa  278  5e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  29.35 
 
 		 1094 aa  268  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.94 
 
 		 1082 aa  216  1.9999999999999998e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  24.54 
 
 		 1090 aa  197  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.94 
 
 		 1193 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26 
 
 		 1067 aa  177  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.09 
 
 		 1097 aa  145  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  28.79 
 
 		 1545 aa  142  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  29.07 
 
 		 1545 aa  142  3.9999999999999997e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  28.09 
 
 		 1125 aa  133  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  30.19 
 
 		 1484 aa  111  6e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  26.98 
 
 		 1084 aa  98.6  6e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  26.24 
 
 		 425 aa  92  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  25.18 
 
 		 483 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  25.18 
 
 		 1076 aa  82.4  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.69 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  23.21 
 
 		 465 aa  81.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  25.78 
 
 		 482 aa  78.2  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  26.53 
 
 		 432 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.51 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  24.32 
 
 		 444 aa  67.8  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  25.19 
 
 		 444 aa  66.2  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 482 aa  64.3  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07501  carboxyl-terminal processing protease  23.47 
 
 		 433 aa  64.3  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  25.39 
 
 		 429 aa  63.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  30.71 
 
 		 377 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0692  carboxyl-terminal protease  24.3 
 
 		 418 aa  63.2  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0346506  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25 
 
 		 409 aa  62.4  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  23.33 
 
 		 444 aa  62  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  23.08 
 
 		 444 aa  61.6  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  23.4 
 
 		 410 aa  60.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  24.54 
 
 		 423 aa  60.1  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 430 aa  60.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 402 aa  59.7  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31 
 
 		 389 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.98 
 
 		 472 aa  59.7  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  24.09 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  25.08 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  22.93 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  23.89 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  26.23 
 
 		 428 aa  57.8  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  24.8 
 
 		 427 aa  57.4  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  23.51 
 
 		 427 aa  57.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  29.69 
 
 		 416 aa  57  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 		 397 aa  57.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  26.49 
 
 		 428 aa  55.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.65 
 
 		 426 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 		 426 aa  55.8  0.000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 		 484 aa  55.5  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1437  carboxyl-terminal protease  27.59 
 
 		 429 aa  55.1  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00028594  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  22.61 
 
 		 434 aa  54.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1299  carboxyl-terminal protease  23.37 
 
 		 449 aa  53.5  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  22.17 
 
 		 440 aa  53.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  24.34 
 
 		 356 aa  53.5  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  20.95 
 
 		 447 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3070  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 383 aa  53.1  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000390096  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  23.08 
 
 		 429 aa  52.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  23.26 
 
 		 436 aa  52.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  26.64 
 
 		 434 aa  52.8  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  29.81 
 
 		 472 aa  52  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4427  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 554 aa  52  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.569103  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  25.45 
 
 		 440 aa  51.6  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  26.74 
 
 		 433 aa  51.6  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_002950  PG1855  carboxyl-terminal protease  33.33 
 
 		 544 aa  50.8  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  24.68 
 
 		 415 aa  50.8  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1775  amidohydrolase  25.89 
 
 		 1010 aa  51.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0563559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 428 aa  50.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  22.04 
 
 		 430 aa  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>