241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1080 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  71.68 
 
 		 1094 aa  1640    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  70.13 
 
 		 1094 aa  1615    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  71.31 
 
 		 1094 aa  1633    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  67.55 
 
 		 1097 aa  1553    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  66.4 
 
 		 1104 aa  1526    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  71.68 
 
 		 1094 aa  1640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  71.29 
 
 		 1093 aa  1634    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  71.38 
 
 		 1093 aa  1634    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  100 
 
 		 1094 aa  2246    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  70.62 
 
 		 1094 aa  1619    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  71.29 
 
 		 1094 aa  1627    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  71.65 
 
 		 1093 aa  1642    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  68.74 
 
 		 1092 aa  1566    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  63.35 
 
 		 1084 aa  1462    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  71.49 
 
 		 1094 aa  1637    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  28.6 
 
 		 1167 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.61 
 
 		 1089 aa  409  1.0000000000000001e-112  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  29.42 
 
 		 1059 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  27.66 
 
 		 1104 aa  387  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  27.7 
 
 		 1117 aa  386  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.17 
 
 		 1079 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  25.34 
 
 		 1075 aa  357  5.999999999999999e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.6 
 
 		 1065 aa  357  5.999999999999999e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  26.52 
 
 		 1016 aa  346  2e-93  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  26.5 
 
 		 1147 aa  321  5e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  26.74 
 
 		 1069 aa  305  4.0000000000000003e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  26.73 
 
 		 1051 aa  297  7e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  29.79 
 
 		 1181 aa  288  2.9999999999999996e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  29.76 
 
 		 1183 aa  278  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  26.52 
 
 		 1008 aa  276  2.0000000000000002e-72  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  25.07 
 
 		 1107 aa  274  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  33.58 
 
 		 1545 aa  243  1e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  33.58 
 
 		 1545 aa  242  2.9999999999999997e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  24.73 
 
 		 1067 aa  237  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  24.75 
 
 		 1082 aa  220  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  22.81 
 
 		 1097 aa  213  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.57 
 
 		 1090 aa  212  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  23.62 
 
 		 1125 aa  203  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  25.72 
 
 		 1186 aa  197  1e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  23.5 
 
 		 1084 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  41.63 
 
 		 1484 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  22.54 
 
 		 1076 aa  163  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  23.9 
 
 		 1193 aa  154  7e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  24.01 
 
 		 1354 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  25.18 
 
 		 427 aa  85.5  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  24.38 
 
 		 465 aa  83.6  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  25.12 
 
 		 425 aa  82.4  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  26.19 
 
 		 482 aa  82.4  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.59 
 
 		 428 aa  81.6  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  24.64 
 
 		 483 aa  79  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.94 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  25.07 
 
 		 426 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.8 
 
 		 472 aa  63.5  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  31.46 
 
 		 416 aa  60.8  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  25.2 
 
 		 432 aa  60.1  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  30.4 
 
 		 441 aa  60.1  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  23.91 
 
 		 430 aa  60.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3801  peptidase S41  23.66 
 
 		 747 aa  59.7  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0586877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  22.22 
 
 		 496 aa  59.7  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  24.12 
 
 		 428 aa  59.3  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  26.34 
 
 		 664 aa  58.5  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  21.77 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.16 
 
 		 397 aa  58.5  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.58 
 
 		 427 aa  58.2  0.0000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.84 
 
 		 377 aa  57.8  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  21.63 
 
 		 1138 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.36 
 
 		 429 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  25.69 
 
 		 1071 aa  56.6  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 		 431 aa  57.4  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1930  carboxyl-terminal protease  21.04 
 
 		 505 aa  57  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0674113  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3700  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 		 401 aa  56.2  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  24.71 
 
 		 444 aa  56.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0408  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 438 aa  55.8  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1420  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 440 aa  55.1  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  22.8 
 
 		 434 aa  55.1  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  19.04 
 
 		 1062 aa  55.5  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  31.51 
 
 		 440 aa  55.5  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.75 
 
 		 457 aa  55.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  20.73 
 
 		 1111 aa  54.7  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2904  carboxyl-terminal protease  25.37 
 
 		 415 aa  54.3  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0010841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  23.58 
 
 		 444 aa  54.3  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  28.42 
 
 		 446 aa  54.3  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2353  carboxyl-terminal protease  22.34 
 
 		 446 aa  54.3  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0201351  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 401 aa  53.5  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  23.87 
 
 		 427 aa  53.5  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 377 aa  53.5  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  25.44 
 
 		 389 aa  53.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1104  carboxy-terminal protease  25 
 
 		 665 aa  53.5  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000153479  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2414  carboxyl-terminal protease  27.78 
 
 		 494 aa  53.1  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0107427  normal  0.156061 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.39 
 
 		 428 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  21.71 
 
 		 418 aa  53.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  24.68 
 
 		 453 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  19.65 
 
 		 1069 aa  52.8  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.4 
 
 		 497 aa  52.8  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  20.62 
 
 		 1081 aa  52.4  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  22.88 
 
 		 429 aa  52.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  23.27 
 
 		 377 aa  52.4  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  22.74 
 
 		 429 aa  52  0.00006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  24.91 
 
 		 379 aa  52  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>