242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1232 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  99.27 
 
 		 1094 aa  2237    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  97.99 
 
 		 1094 aa  2194    Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  88.67 
 
 		 1094 aa  2047    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  94.24 
 
 		 1094 aa  2137    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  71.3 
 
 		 1097 aa  1630    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  98.9 
 
 		 1094 aa  2226    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  73.79 
 
 		 1094 aa  1686    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  89.95 
 
 		 1093 aa  2059    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  89.76 
 
 		 1093 aa  2054    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  70.54 
 
 		 1092 aa  1628    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  71.58 
 
 		 1094 aa  1617    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  89.95 
 
 		 1093 aa  2060    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  64.41 
 
 		 1084 aa  1462    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  100 
 
 		 1094 aa  2248    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  70.56 
 
 		 1104 aa  1615    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  30.11 
 
 		 1089 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.73 
 
 		 1167 aa  436  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1059 aa  410  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.43 
 
 		 1117 aa  413  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  29.28 
 
 		 1104 aa  407  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  28.19 
 
 		 1079 aa  384  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  29.08 
 
 		 1016 aa  377  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  26.5 
 
 		 1075 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  27.92 
 
 		 1065 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  27.07 
 
 		 1069 aa  337  9e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  31.38 
 
 		 1181 aa  316  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1051 aa  314  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  26.47 
 
 		 1147 aa  309  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  30.69 
 
 		 1183 aa  308  5.0000000000000004e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  27 
 
 		 1107 aa  301  6e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  27.08 
 
 		 1008 aa  290  1e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  25.71 
 
 		 1067 aa  259  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  35.67 
 
 		 1545 aa  249  3e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  35.46 
 
 		 1545 aa  248  6.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  23.35 
 
 		 1090 aa  233  2e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.91 
 
 		 1125 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  30.14 
 
 		 1186 aa  209  2e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.08 
 
 		 1082 aa  207  8e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  22.55 
 
 		 1097 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  43.75 
 
 		 1484 aa  167  9e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.07 
 
 		 1193 aa  164  9e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  21.31 
 
 		 1084 aa  163  2e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.19 
 
 		 1076 aa  148  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.29 
 
 		 1354 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  24.82 
 
 		 483 aa  89.4  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.31 
 
 		 425 aa  89  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.75 
 
 		 428 aa  88.2  7e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  24.33 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  26.55 
 
 		 465 aa  84  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  22.79 
 
 		 427 aa  82.4  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  24.74 
 
 		 389 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  28.37 
 
 		 416 aa  70.1  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  23.12 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  24.33 
 
 		 457 aa  65.1  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  23.75 
 
 		 1062 aa  65.1  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.95 
 
 		 429 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  23.84 
 
 		 472 aa  63.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  24.87 
 
 		 431 aa  63.5  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1480  carboxyl-terminal protease  22.11 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1509  carboxyl-terminal protease  22.11 
 
 		 496 aa  62.8  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0266  carboxyl-terminal protease  24.38 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000503976  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  33.33 
 
 		 446 aa  60.1  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  29.46 
 
 		 441 aa  59.7  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0364  carboxyl-terminal protease  23.68 
 
 		 377 aa  59.3  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000110985  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 444 aa  59.3  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  24.07 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1600  carboxyl-terminal protease  24.6 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.516167  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.2 
 
 		 1071 aa  58.2  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  23.93 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  21.68 
 
 		 1113 aa  58.2  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.26 
 
 		 428 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0677  carboxyl-terminal protease  23.95 
 
 		 444 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.994343  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 449 aa  57.4  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.33 
 
 		 447 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  24.12 
 
 		 428 aa  57.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 462 aa  56.6  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 450 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  25.25 
 
 		 397 aa  57  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07321  carboxyl-terminal processing protease  22.69 
 
 		 444 aa  57  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.587372  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  32.1 
 
 		 434 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  30.23 
 
 		 449 aa  56.2  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  32.1 
 
 		 434 aa  56.2  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_308  carboxyl-terminal protease  23.81 
 
 		 377 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000103744  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  23.6 
 
 		 440 aa  55.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  23.76 
 
 		 427 aa  55.8  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07301  carboxyl-terminal processing protease  22.96 
 
 		 444 aa  55.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  32.1 
 
 		 434 aa  55.8  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.84 
 
 		 418 aa  55.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  25.27 
 
 		 664 aa  55.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  23.39 
 
 		 426 aa  55.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  31.4 
 
 		 450 aa  55.1  0.000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  32.88 
 
 		 440 aa  54.7  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0248  C-terminal processing peptidase  23.89 
 
 		 389 aa  54.7  0.000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000014936  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1178  peptidase S41A, C-terminal protease  25.48 
 
 		 444 aa  54.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0458  amidohydrolase  21.15 
 
 		 1138 aa  54.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.455594 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  26.35 
 
 		 453 aa  54.3  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  24.15 
 
 		 402 aa  53.5  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  22.52 
 
 		 446 aa  53.9  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0043  C-terminal processing peptidase-3  23.41 
 
 		 401 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000408883 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>