109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7083 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  44.8 
 
 		 1051 aa  818    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  49.65 
 
 		 1069 aa  937    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  100 
 
 		 1147 aa  2261    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  50.82 
 
 		 1107 aa  1034    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  39.51 
 
 		 1186 aa  673    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  36.68 
 
 		 1104 aa  619  1e-176  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  36.9 
 
 		 1117 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  35.86 
 
 		 1089 aa  587  1e-166  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  43.29 
 
 		 1183 aa  575  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  35.54 
 
 		 1059 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  45.11 
 
 		 1181 aa  567  1e-160  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  34.12 
 
 		 1016 aa  501  1e-140  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  31.49 
 
 		 1008 aa  478  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  25.9 
 
 		 1079 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  29.31 
 
 		 1167 aa  369  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  27.25 
 
 		 1075 aa  364  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  28.99 
 
 		 1084 aa  360  9.999999999999999e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  33.51 
 
 		 1065 aa  342  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  27.8 
 
 		 1094 aa  332  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  27.33 
 
 		 1104 aa  325  2e-87  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  27.3 
 
 		 1093 aa  325  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  25.98 
 
 		 1092 aa  322  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  27.05 
 
 		 1093 aa  321  5e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  26.87 
 
 		 1094 aa  321  6e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  27.05 
 
 		 1093 aa  319  2e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  27.23 
 
 		 1094 aa  316  1.9999999999999998e-84  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  25.9 
 
 		 1094 aa  313  7.999999999999999e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  25.97 
 
 		 1097 aa  313  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  26.67 
 
 		 1094 aa  312  2e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  26.58 
 
 		 1094 aa  313  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  26.5 
 
 		 1094 aa  310  9e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  26.67 
 
 		 1094 aa  308  3e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  26.11 
 
 		 1354 aa  288  2.9999999999999996e-76  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  25.66 
 
 		 1082 aa  217  9e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.68 
 
 		 1067 aa  213  2e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  23.84 
 
 		 1097 aa  167  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  30.16 
 
 		 1193 aa  141  8.999999999999999e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  29.16 
 
 		 1090 aa  137  8e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  28.39 
 
 		 1545 aa  130  1.0000000000000001e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  28.17 
 
 		 1545 aa  129  4.0000000000000003e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  21.65 
 
 		 1076 aa  118  5e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  30.32 
 
 		 1125 aa  109  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  30.93 
 
 		 1484 aa  102  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.02 
 
 		 428 aa  75.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25 
 
 		 1084 aa  73.6  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  21.45 
 
 		 425 aa  61.6  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  30.06 
 
 		 483 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  30.86 
 
 		 482 aa  60.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  25.53 
 
 		 457 aa  55.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0287  carboxyl-terminal protease  27.01 
 
 		 377 aa  55.8  0.000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  31.15 
 
 		 389 aa  55.5  0.000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0686  translocation protein TolB  32 
 
 		 461 aa  54.7  0.000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.223253  normal  0.228867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  34.71 
 
 		 434 aa  53.5  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  30.93 
 
 		 416 aa  53.9  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  31.2 
 
 		 442 aa  53.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.21 
 
 		 418 aa  53.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.77 
 
 		 442 aa  52.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.54 
 
 		 445 aa  51.6  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  23.13 
 
 		 444 aa  50.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  34.29 
 
 		 451 aa  49.7  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.37 
 
 		 446 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.37 
 
 		 446 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.5 
 
 		 397 aa  49.7  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  25.12 
 
 		 410 aa  49.3  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.73 
 
 		 427 aa  48.9  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  22.92 
 
 		 427 aa  48.9  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  31.82 
 
 		 428 aa  48.9  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  34.26 
 
 		 442 aa  48.9  0.0006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  34.55 
 
 		 567 aa  48.5  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00700  translocation protein TolB precursor  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000197077  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2895  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000023315  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0769  translocation protein TolB  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000591343  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  39.47 
 
 		 316 aa  47.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2915  translocation protein TolB  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000243248  normal  0.51862 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0763  translocation protein TolB  37.17 
 
 		 431 aa  47.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000112892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3783  carboxyl-terminal protease  28.9 
 
 		 434 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0662  translocation protein TolB  37.17 
 
 		 430 aa  47.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000673794  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  28.57 
 
 		 446 aa  48.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0843  translocation protein TolB  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000968933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  27.22 
 
 		 465 aa  47.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  29.91 
 
 		 435 aa  47.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00689  hypothetical protein  37.17 
 
 		 430 aa  47.4  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000219845  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  24.73 
 
 		 429 aa  47  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  26.02 
 
 		 438 aa  47  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1631  WD40 domain-containing protein  35.38 
 
 		 347 aa  47.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  27.38 
 
 		 426 aa  47.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4863  Periplasmic protease-like protein  30.81 
 
 		 472 aa  47  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  21.45 
 
 		 416 aa  46.2  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1238  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 430 aa  46.6  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00586154  normal  0.133449 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  24.01 
 
 		 432 aa  46.6  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  22.65 
 
 		 377 aa  46.2  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  27.57 
 
 		 430 aa  45.8  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0811  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188067  normal  0.784941 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0875  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0139765  normal  0.325318 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0907  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.077859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0784  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000303788  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0844  translocation protein TolB  36.28 
 
 		 431 aa  46.2  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0211285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  24.89 
 
 		 1652 aa  45.8  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  32.41 
 
 		 442 aa  45.8  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03547  carboxyl-terminal protease  25.87 
 
 		 507 aa  45.8  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>