More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3891 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  39.52 
 
 		 1075 aa  785    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3891  peptidase S41  100 
 
 		 1079 aa  2228    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0939708  hitchhiker  0.00000524124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  33.15 
 
 		 1167 aa  612  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2799  peptidase S41  28.3 
 
 		 1117 aa  454  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.38727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1092  peptidase S41  28.84 
 
 		 1104 aa  451  1e-125  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.588085  normal  0.0332466 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0668  peptidase S41  29.94 
 
 		 1069 aa  447  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4060  hypothetical protein  29.96 
 
 		 1059 aa  430  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00663013  normal  0.0372283 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  29.55 
 
 		 1097 aa  433  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4892  peptidase S41  29.35 
 
 		 1089 aa  425  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  29.18 
 
 		 1094 aa  422  1e-116  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1766  peptidase S41  28.49 
 
 		 1065 aa  408  1.0000000000000001e-112  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  29.51 
 
 		 1104 aa  404  1e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  28.05 
 
 		 1092 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  28.81 
 
 		 1084 aa  402  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  28.96 
 
 		 1016 aa  399  1e-109  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  28.48 
 
 		 1093 aa  398  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  28.53 
 
 		 1094 aa  395  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  28.31 
 
 		 1093 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  28.27 
 
 		 1093 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  28.69 
 
 		 1094 aa  391  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  28.41 
 
 		 1094 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  28.41 
 
 		 1094 aa  382  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  28.41 
 
 		 1094 aa  383  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1676  hypothetical protein  27.49 
 
 		 1051 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.665877 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  28.32 
 
 		 1094 aa  380  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7084  peptidase S41  28.42 
 
 		 1107 aa  370  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.974034  normal  0.25867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1080  peptidase S41  27.87 
 
 		 1094 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000759167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7083  peptidase S41  25.83 
 
 		 1147 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.194144  normal  0.204696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  26.86 
 
 		 1067 aa  358  3.9999999999999996e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.04 
 
 		 1090 aa  342  2.9999999999999998e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2811  peptidase S41  26.62 
 
 		 1008 aa  339  9.999999999999999e-92  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.16663  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.33 
 
 		 1082 aa  327  9e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1602  peptidase S41  31.21 
 
 		 1181 aa  323  9.999999999999999e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000100901 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1608  peptidase S41  30.81 
 
 		 1183 aa  323  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.766197  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.49 
 
 		 1097 aa  281  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0089  tricorn protease  25.73 
 
 		 1084 aa  271  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000582269  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6483  peptidase S41  24.67 
 
 		 1125 aa  261  4e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2750  peptidase S41  24.42 
 
 		 1076 aa  250  1e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.956539  normal  0.394913 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30960  Tol biopolymer transport system, periplasmic component-related protein  29.25 
 
 		 1186 aa  248  4e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33125  predicted protein  23.78 
 
 		 1354 aa  248  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.517999  normal  0.0400566 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46565  predicted protein  27.19 
 
 		 1545 aa  171  6e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400003  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46562  predicted protein  27.34 
 
 		 1545 aa  171  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.252798  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0147  peptidase S41  25.06 
 
 		 1193 aa  135  3e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_26649  predicted protein  25.84 
 
 		 1484 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  27.61 
 
 		 427 aa  97.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  23.88 
 
 		 428 aa  95.9  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.22 
 
 		 425 aa  94.4  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  28.93 
 
 		 567 aa  82  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  21.61 
 
 		 1005 aa  80.1  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  35.59 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1253  TolB periplasmic receptor  33.33 
 
 		 430 aa  77.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0142198  normal  0.831456 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1133  TolB-like  31.91 
 
 		 430 aa  74.7  0.000000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  20.55 
 
 		 969 aa  73.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  25.44 
 
 		 428 aa  74.3  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  23.04 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  22.03 
 
 		 447 aa  73.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  22.86 
 
 		 1071 aa  72  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0293  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 428 aa  71.2  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0636563  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  22.61 
 
 		 1040 aa  71.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  22.2 
 
 		 1059 aa  70.9  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0346  carboxyl-terminal protease  26.92 
 
 		 377 aa  70.5  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000371247  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 444 aa  70.1  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  23.92 
 
 		 457 aa  70.5  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  30.68 
 
 		 446 aa  69.7  0.0000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  34.85 
 
 		 441 aa  69.7  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  28.57 
 
 		 450 aa  69.3  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  37.65 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  21.31 
 
 		 1067 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  21.91 
 
 		 1069 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  40.48 
 
 		 615 aa  68.2  0.0000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  23.47 
 
 		 1014 aa  68.2  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  28 
 
 		 450 aa  68.2  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  34.02 
 
 		 316 aa  67.4  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  26.86 
 
 		 449 aa  67.4  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  22.54 
 
 		 717 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  22.4 
 
 		 1031 aa  67.8  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  28.57 
 
 		 437 aa  67.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  22.32 
 
 		 1066 aa  67.8  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  22.56 
 
 		 432 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  40.96 
 
 		 451 aa  67.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1857  translocation protein TolB  32.84 
 
 		 442 aa  67  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00113428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 449 aa  67.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16350  carboxyl-terminal protease  25.45 
 
 		 379 aa  67  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000563274  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6416  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  31.18 
 
 		 362 aa  67  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  39.51 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  22.27 
 
 		 429 aa  66.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  23.06 
 
 		 389 aa  66.2  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  27.43 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  23.39 
 
 		 427 aa  66.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  40.96 
 
 		 461 aa  66.2  0.000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  27.23 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  23.98 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3963  carboxyl-terminal protease  26.6 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000206146  hitchhiker  0.00000000432275 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2133  translocation protein TolB  35.96 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  39.19 
 
 		 629 aa  64.7  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0249  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  26.26 
 
 		 497 aa  64.3  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2692  translocation protein TolB  31.5 
 
 		 408 aa  63.9  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.319845  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  22.79 
 
 		 1042 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  41.18 
 
 		 440 aa  63.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0028  amidohydrolase  22.75 
 
 		 1062 aa  63.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.847177  hitchhiker  0.00656795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>